RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 TAS2R40P59535 323 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 NAA20P61599 178 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 GSTO1P78417 241 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF543Q08ER8 600 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 BST1Q10588 318 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 PTK7Q13308 1070 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 MTM1Q13496 603 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 ACAP1Q15027 740 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 C2CD6Q53TS8 623 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 BORAQ6PGQ7 559 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 C1orf186Q6ZWK4 172 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 CCDC80Q76M96 950 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 CRLF3Q8IUI8 442 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 TPH2Q8IWU9 490 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 SLC15A3Q8IY34 581 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 TTC13Q8NBP0 860 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 FBXO36Q8NEA4 188 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 C17orf50Q8WW18 174 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 SHC3Q92529 594 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 E2F7Q96AV8 911 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 C7orf26Q96N11 449 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 MBOAT7Q96N66 472 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF696Q9H7X3 374 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 CYP4F11Q9HBI6 524 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 GINM1Q9NU53 330 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 MTMR4Q9NYA4 1195 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 NFASCO94856 1347 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 KANSL1LA0AUZ9 987 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 COPEO14579 308 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 TBX3O15119 743 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 CBFA2T3O75081 653 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 CRTAMO95727 393 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 PROCP04070 461 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 CD48P09326 243 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 POLR2MP0CAP2 368 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 AOC1P19801 751 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 MXI1P50539 228 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 MYBPC1Q00872 1141 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 GAD2Q05329 585 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 C16orf72Q14CZ0 275 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 FNBP1LQ5T0N5 605 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 CIAPIN1Q6FI81 312 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 PACS1Q6VY07 963 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 CLEC10AQ8IUN9 316 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 MCOLN2Q8IZK6 566 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 EXD1Q8NHP7 514 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 GIPC3Q8TF64 312 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 FIZ1Q96SL8 496 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 SEL1LQ9UBV2 794 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 POMPQ9Y244 141 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.54□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 ZBTB39O15060 712 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 TRPA1O75762 1119 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 CALCAP01258 141 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 FAM58BPP0C7Q3 252 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 KRT5P13647 590 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 NOVP48745 357 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 COPAP53621 1224 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 PPP4CP60510 307 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 FAAP100Q0VG06 881 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 CHI3L2Q15782 390 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 ERFEQ4G0M1 354 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 MSS51Q4VC12 460 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM53Q6P2H8 277 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 MOXD1Q6UVY6 613 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 TXNRD3Q86VQ6 643 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 FAM20AQ96MK3 541 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 GLT8D2Q9H1C3 349 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 RRN3Q9NYV6 651 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 CDH22Q9UJ99 828 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 RAB26Q9ULW5 256 aa7.53□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms