RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 FNIP1Q8TF40 1166 aa22.23■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 RXFP2Q8WXD0 754 aa22.23■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 31.9
RFXAP-201ENST00000255476 RTP3Q9BQQ7 232 aa22.23■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 PLVAPQ9BX97 442 aa22.23■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 ZWILCHQ9H900 591 aa22.23■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 RALAP11233 206 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 MCM3P25205 808 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 IL1R2P27930 398 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 GATMP50440 423 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 KCNT1Q5JUK3 1230 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 STK32AQ8WU08 396 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 ZBTB9Q96C00 473 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 MED10Q9BTT4 135 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 C2CD4BA6NLJ0 364 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 FSCN2O14926 492 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 FAM163BP0C2L3 166 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 ODC1P11926 461 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 CARSP49589 748 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 SLC6A3Q01959 620 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 CLUL1Q15846 466 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 TRIM60Q495X7 471 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 TTC27Q6P3X3 843 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 PIGZQ86VD9 579 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 IFT81Q8WYA0 676 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 HIPK3Q9H422 1215 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 GDF3Q9NR23 364 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.22■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 KRT1P04264 644 aa22.21■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 PDGFRAP16234 1089 aa22.21■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 TLE2Q04725 743 aa22.21■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 FAAP100Q0VG06 881 aa22.21■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 CDO1Q16878 200 aa22.21■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 EXD1Q8NHP7 514 aa22.21■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa22.21■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.21■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 RAPGEF5Q92565 580 aa22.21■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 PCED1BQ96HM7 432 aa22.21■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 CFAP57Q96MR6 1250 aa22.21■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 DUSP16Q9BY84 665 aa22.21■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.21■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.21■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 TTC3P53804 2025 aa22.21■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 PHF2O75151 1096 aa22.2■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 GPD1P21695 349 aa22.2■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 CYP2C18P33260 490 aa22.2■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.2■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.2■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 UROC1Q96N76 676 aa22.2■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.2■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 FUT8Q9BYC5 575 aa22.2■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 KRT10P13645 584 aa22.2■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 ADCY2Q08462 1091 aa22.2■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 DSC1Q08554 894 aa22.2■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.2■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.2■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 IFT20Q8IY31 132 aa22.2■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.2■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 ATG4AQ8WYN0 398 aa22.2■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 SEPT8Q92599 483 aa22.2■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.2■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 OSBPL8Q9BZF1 889 aa22.2■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.2■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 KRT82Q9NSB4 513 aa22.2■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.2■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.2■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 M0QZQ0 153 aa22.19■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 NPR3P17342 541 aa22.19■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 MIPP30301 263 aa22.19■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 PLA2G4AP47712 749 aa22.19■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 OR1G1P47890 313 aa22.19■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 KCNJ1P48048 391 aa22.19■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 CACNA2D1P54289 1103 aa22.19■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 MAP3K7CLP57077 242 aa22.19■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 ATP11AP98196 1134 aa22.19■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 LRRC38Q5VT99 294 aa22.19■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.19■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.19■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.19■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 URGCPQ8TCY9 931 aa22.19■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF333Q96JL9 665 aa22.19■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.19■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 TMEM209Q96SK2 561 aa22.19■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.19■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 NFU1Q9UMS0 254 aa22.19■■□□□ 1.14
RFXAP-201ENST00000255476 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms