RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 TCF3P15923 654 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 PPP3CCP48454 512 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 CUL4BQ13620 913 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 FBXO43Q4G163 708 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF516Q92618 1163 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 CHFRQ96EP1 664 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 C8orf48Q96LL4 319 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 DMXL1Q9Y485 3027 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 C2orf78A6NCI8 922 aa22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 PHACTR2O75167 634 aa22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 EGFP01133 1207 aa22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 USP4Q13107 963 aa22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 A8MXQ7 604 aa22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 RNF40O75150 1001 aa22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 SLFN14P0C7P3 912 aa22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 AP3M2P53677 418 aa22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 MYL6P60660 151 aa22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 EML3Q32P44 896 aa22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 CAMKK1Q8N5S9 505 aa22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 CD101Q93033 1021 aa22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 F8VP50 259 aa22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 PTPRDP23468 1912 aa22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 USP46P62068 366 aa22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 PSMD2Q13200 908 aa22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 RTKNQ9BST9 563 aa22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 SEMA4GQ9NTN9 838 aa22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 NME7Q9Y5B8 376 aa22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF840PA6NDX5 716 aa22.43■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 NFATC1O95644 943 aa22.43■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 CSRP2Q16527 193 aa22.43■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.43■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 GAB3Q8WWW8 586 aa22.43■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.43■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.43■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.43■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 HOXC13P31276 330 aa22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 SLC7A9P82251 487 aa22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 STK4Q13043 487 aa22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 BIRC3Q13489 604 aa22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 PAGE5Q96GU1 130 aa22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 EXOC1Q9NV70 894 aa22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 USP25Q9UHP3 1055 aa22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 DNAH14Q0VDD8 3507 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 LEFTY2O00292 366 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 KLRC4O43908 158 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 RPP40O75818 363 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 ABL1P00519 1130 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 PXNP49023 591 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 CASP4P49662 377 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 CLDN10P78369 228 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 TAF10Q12962 218 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 PKP1Q13835 747 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 NUP93Q8N1F7 819 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 NETO1Q8TDF5 533 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 LOXL4Q96JB6 756 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 DMAC2Q9NW81 257 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 ATP8B3O60423 1300 aa22.4■■□□□ 1.18
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