RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000235347.4

PRAMEF10-201, Transcript of PRAME family member 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF10, Length 1,525 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10-201ENST00000235347 IQCEQ6IPM2 695 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 SYCE2Q6PIF2 218 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMEM270Q6UE05 265 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 CCDC149Q6ZUS6 474 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 KIAA1328Q86T90 577 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 TCEAL8Q8IYN2 117 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 CRYBG2Q8N1P7 616 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 SLC4A11Q8NBS3 891 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 SPPL2BQ8TCT7 592 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 HDAC7Q8WUI4 952 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 APOL5Q9BWW9 433 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 UBXN6Q9BZV1 441 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 TSGA10Q9BZW7 698 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 SFXN1Q9H9B4 322 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 FAM49BQ9NUQ9 324 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 CEP72Q9P209 647 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 DNAJC12Q9UKB3 198 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 DOCK6Q96HP0 2047 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 NOTCH4Q99466 2003 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 DENND4CQ5VZ89 1909 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 CTAGE15A4D2H0 777 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 LRRC53A6NM62 1247 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 H3BQ06 376 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 PRRG1O14668 218 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 PJA2O43164 708 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 SOAT2O75908 522 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 CTAGE8P0CG41 777 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 CCDC130P13994 396 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 UCHL3P15374 230 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 KCNA5P22460 613 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 RFX1P22670 979 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 HOXA9P31269 272 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 ELF1P32519 619 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 PLA2G4AP47712 749 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 KIF11P52732 1056 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 RAPGEF1Q13905 1077 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 CLUL1Q15846 466 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 MGAT5BQ3V5L5 792 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 CFAP221Q4G0U5 840 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 PPM1LQ5SGD2 360 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 HGSNATQ68CP4 663 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 CTAGE6Q86UF2 777 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 FAM35AQ86V20 835 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 CTAGE4Q8IX94 777 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 C12orf29Q8N999 325 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 NEK11Q8NG66 645 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 SHC3Q92529 594 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 HLA-CQ95604 372 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMEM176AQ96HP8 235 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 FAM81BQ96LP2 452 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 B3GNT5Q9BYG0 378 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 GPR88Q9GZN0 384 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 ABCB6Q9NP58 842 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMEM30AQ9NV96 361 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 HSFX1Q9UBD0 423 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 DPP7Q9UHL4 492 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 CDH22Q9UJ99 828 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 MAFFQ9ULX9 164 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 TFR2Q9UP52 801 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 CNTN6Q9UQ52 1028 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 CLDN5O00501 218 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 CCL16O15467 120 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 SASH3O75995 380 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 PAPLNO95428 1278 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 CALCAP01258 141 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 KRT5P13647 590 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 ATF6P18850 670 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 BDNFP23560 247 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 CYP2F1P24903 491 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAMEF10-201ENST00000235347 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms