RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
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SLC25A39-201ENST00000225308 ZSWIM1Q9BR11 485 aa23.05■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 IL21Q9HBE4 155 aa23.05■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.283e-6■□□□□ 9.5
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SLC25A39-201ENST00000225308 O00370 1275 aa23.04■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 VDRP11473 427 aa23.04■■□□□ 1.28
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SLC25A39-201ENST00000225308 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa23.04■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 OTOP3Q7RTS5 596 aa23.04■■□□□ 1.28
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SLC25A39-201ENST00000225308 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 MYRFLQ96LU7 910 aa23.04■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 GPR88Q9GZN0 384 aa23.04■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 KIAA1257Q9ULG3 409 aa23.04■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
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SLC25A39-201ENST00000225308 MYO16Q9Y6X6 1858 aa23.04■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 SERPINC1P01008 464 aa23.04■■□□□ 1.28
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SLC25A39-201ENST00000225308 CEBPBP17676 345 aa23.04■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 MAP3K7CLP57077 242 aa23.04■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 USP46P62068 366 aa23.04■■□□□ 1.28
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SLC25A39-201ENST00000225308 TAF12Q16514 161 aa23.04■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 POTEHQ6S545 545 aa23.04■■□□□ 1.28
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SLC25A39-201ENST00000225308 RNF214Q8ND24 703 aa23.04■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 SHKBP1Q8TBC3 707 aa23.04■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 DUSP16Q9BY84 665 aa23.04■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 ACP6Q9NPH0 428 aa23.04■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 TSPAN16Q9UKR8 245 aa23.04■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A1W2PRU2 124 aa23.03■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF197O14709 1029 aa23.03■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 TNFRSF10BO14763 440 aa23.03■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 MICAL2O94851 1124 aa23.03■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 GJA1P17302 382 aa23.03■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 GABRR2P28476 465 aa23.03■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 RAPGEF1Q13905 1077 aa23.03■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 PTPN21Q16825 1174 aa23.03■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 FILIP1LQ4L180 1135 aa23.03■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 SMYD5Q6GMV2 418 aa23.03■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM150AQ86TG1 271 aa23.03■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 TTC30AQ86WT1 665 aa23.03■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 TTLL2Q9BWV7 592 aa23.03■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 CD320Q9NPF0 282 aa23.03■■□□□ 1.28
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SLC25A39-201ENST00000225308 BRD2P25440 801 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 ANKRD52Q8NB46 1076 aa23.02■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 CDH7Q9ULB5 785 aa23.02■■□□□ 1.28
SLC25A39-201ENST00000225308 HHLA1C9JL84 531 aa23.01■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 LAMP2P13473 410 aa23.01■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 USP8P40818 1118 aa23.01■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 NR1I3Q14994 352 aa23.01■■□□□ 1.27
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SLC25A39-201ENST00000225308 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.01■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM71AQ8IYT1 594 aa23.01■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 PNPLA8Q9NP80 782 aa23.01■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
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SLC25A39-201ENST00000225308 F8VZ95 297 aa23■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 TADA3O75528 432 aa23■■□□□ 1.27
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SLC25A39-201ENST00000225308 SLC5A3P53794 718 aa23■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 TEAD2Q15562 447 aa23■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 PKDCCQ504Y2 493 aa23■■□□□ 1.27
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SLC25A39-201ENST00000225308 NUP93Q8N1F7 819 aa23■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 SCAMP5Q8TAC9 235 aa23■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 STK33Q9BYT3 514 aa23■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 EPS15L1Q9UBC2 864 aa23■■□□□ 1.27
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SLC25A39-201ENST00000225308 CYP26A1O43174 497 aa23■■□□□ 1.27
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SLC25A39-201ENST00000225308 BCAT1P54687 386 aa23■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 CNGA2Q16280 664 aa23■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa23■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 GJD3Q8N144 294 aa23■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 NEK11Q8NG66 645 aa23■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 ATXN3LQ9H3M9 355 aa23■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 NLRC4Q9NPP4 1024 aa23■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 GDE1Q9NZC3 331 aa23■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 IL37Q9NZH6 218 aa23■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa23■■□□□ 1.27
SLC25A39-201ENST00000225308 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
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