RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000056749.13

Nhlrc3-201, Transcript of NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nhlrc3, Length 5,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 R3hdm4Q4VBF2 262 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pacsin1Q61644 441 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ripor1Q68FE6 1223 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Slc25a24Q8BMD8 475 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 RnpepQ8VCT3 650 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Zfp64Q99KE8 643 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 NgrnQ99KS2 293 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Dis3Q9CSH3 958 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Vps28Q9D1C8 221 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ephx1Q9D379 455 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gpn3Q9D3W4 284 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Scyl3Q9DBQ7 735 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Prdm12A2AJ77 365 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gm28043E0CXC2 719 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gm3264L7N2C5 238 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 PtgisO35074 501 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Smpd2O70572 419 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Il2rbP16297 539 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ggnbp1Q6K1E7 370 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Stk38lQ7TSE6 464 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pcdh19Q80TF3 1145 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 WhrnQ80VW5 918 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 NrcamQ810U4 1256 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Smtnl2Q8CI12 456 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Prpf39Q8K2Z2 665 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Prpf4Q9DAW6 521 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Arid3bQ9Z1N7 568 aa11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 CkmP07310 381 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cyp2f2P33267 491 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ano7Q14AT5 859 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ap5z1Q3U829 807 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Trim75Q3UWZ0 467 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Abi3bpQ59IW6 1179 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Znf280dQ68FE8 974 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Q6GQU0 248 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ildr1Q8CBR1 537 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Angel1Q8VCU0 667 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 2310003L06RikQ9CV82 495 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Prl3b1P09586 222 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cyp2c37P56654 490 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Rab6bP61294 208 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Klra5Q60652 266 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 NntQ61941 1086 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ticam2Q8BJQ4 232 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gpr180Q8BPS4 441 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 4921511C20RikQ8BVT7 469 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ccdc81Q9D5W4 654 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 FignQ9ERZ6 759 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Nup50Q9JIH2 466 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gbp6A0A0G2JDV3 611 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Magea10A2AMW4 325 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gm3460E9QAI8 215 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Serpina3mQ03734 418 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tespa1Q3U132 458 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Mpzl3Q3V3F6 237 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ssxb10Q6XAR7 170 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Vmn1r206Q8R277 312 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Klhl28Q9CR40 571 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Atp6ap2Q9CYN9 350 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cyp4f17G3UW78 524 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Rab23P35288 237 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Setdb2Q8C267 713 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ston1Q8CDJ8 730 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 PdgfcQ8CI19 345 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tada3Q8R0L9 432 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cyp4f16Q99N17 524 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Themis3Q9CU24 569 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 KynuQ9CXF0 464 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Usp29Q9ES63 869 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cdc42ep5Q9Z0X0 150 aa11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ddx39bQ9Z1N5 428 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Dhtkd1A2ATU0 921 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Irf3P70671 419 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cyp2j11Q3UNV2 504 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Msantd2Q6NZR2 559 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 LppQ8BFW7 613 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ccdc186Q8C9S4 917 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Dhx35A2ACQ1 703 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tada2bD3Z4Z0 420 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Hk1P17710 974 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ptpn11P35235 597 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 PhexP70669 749 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ptcd3Q14C51 685 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 P3h1Q3V1T4 739 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 RhocQ62159 193 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 PtprcapQ64697 197 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Nipal1Q8BMW7 416 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Mrpl47Q8K2Y7 252 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ppp2r2dQ925E7 453 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pkp2Q9CQ73 795 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Snf8Q9CZ28 258 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pcna-ps2A0A140T8V5 261 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Zscan4dA7KBS4 506 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ccdc24E9PUW8 296 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Smad1P70340 465 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Slc8a1P70414 970 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Fbln1Q08879 705 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Zscan4fQ3URS2 506 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Sema5aQ62217 1077 aa11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Zscan4cQ80VJ6 506 aa11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33 ms