RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20509G3UZF1 325 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Apba3O88888 571 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 KitP05532 979 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Usp10P52479 792 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eif3eP60229 445 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Actr2P61161 394 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smyd1P97443 490 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpsm3Q3U1Z5 159 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DeptorQ570Y9 409 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Syn2Q64332 586 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmcc1Q69ZZ6 649 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RfflQ6ZQM0 377 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eif2aQ8BJW6 581 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GlmnQ8BZM1 596 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q8CD60 292 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adgrg2Q8CJ12 1009 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tgif2lx2Q8K5B9 231 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kdelr1Q99JH8 212 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tdrd1Q99MV1 1172 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rassf3Q99P51 232 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MceeQ9D1I5 178 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tekt1Q9DAJ2 418 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nudt5Q9JKX6 218 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cntnap1O54991 1385 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ripor3A1L3T7 938 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dpy19l4A2AJQ3 722 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rabgap1A2AWA9 1064 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc10a3P21129 473 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fgfr2P21803 821 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HalP35492 657 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prmt9Q3U3W5 846 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 OtulinQ3UCV8 352 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lgr6Q3UVD5 967 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prkaa1Q5EG47 559 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Map3k7Q62073 579 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Srd5a1Q68FF9 255 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bnip1Q6QD59 228 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf507Q6ZPY5 941 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ush1gQ80T11 461 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Neto2Q8BNJ6 525 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tyw3Q8BSA9 257 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Phka2Q8BWJ3 1235 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gga1Q8R0H9 635 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Stard7Q8R1R3 373 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Coq6Q8R1S0 476 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q8R1Y2 203 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rhobtb2Q91V93 728 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tex19.1Q99MV2 351 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dkc1Q9ESX5 509 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Caln1Q9JJG7 219 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trpc2Q9R244 1172 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptpn4Q9WU22 926 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm29133A0A1B0GT72 266 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam171a2A2A699 822 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Maml3D4QGC2 1135 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdr1E9Q0B4 517 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bmpr2O35607 1038 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc1a2P43006 572 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyth2P63034 400 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Map4k1P70218 827 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gata5P97489 404 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nsun2Q1HFZ0 757 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mif4gdQ3UBZ5 222 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Elf3Q3UPW2 391 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rbl2Q64700 1135 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lsm8Q6ZWM4 96 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Usp1Q8BJQ2 784 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc68Q8BVC4 333 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr809Q8VEX8 328 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nme5Q99MH5 211 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Txndc12Q9CQU0 170 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q9D1Z2 194 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttc33Q9D6K7 262 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dtwd1Q9D8U7 304 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plscr2Q9DCW2 307 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccr10Q9JL21 362 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Copg2Q9QXK3 871 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Capn7Q9R1S8 813 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc26a3Q9WVC8 757 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HnrnpcQ9Z204 313 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mbd1Q9Z2E2 636 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krt27Q9Z320 448 aa6.89□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm27029A2A4P4 543 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rap1gapA2ALS5 663 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smok3aC0HKC8 504 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smok3bC0HKC9 504 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lilra5D3Z7A9 295 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm4841E9QAA8 417 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serpinh1P19324 417 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cst8P32766 142 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sesn2P58043 480 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf746Q3U133 652 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rcsd1Q3UZA1 412 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Capn11Q6J756 714 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clec4gQ8BNX1 294 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rhpn2Q8BWR8 686 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rfx6Q8C7R7 927 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem132cQ8CEF9 1099 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fcho1Q8K285 873 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acvr1cQ8K348 493 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.8 ms