RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ttc26Q8BS45 554 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Robo4Q8C310 1012 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 OgtQ8CGY8 1046 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arap3Q8R5G7 1538 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zscan4dA7KBS4 506 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 FanceB8JJD6 213 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zscan4fQ3URS2 506 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trpc1Q61056 793 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zscan4cQ80VJ6 506 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zbtb46Q8BID6 600 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zdhhc12Q8VC90 267 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pcdha3Q91Y16 942 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zmynd10Q99ML0 440 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Egfl8Q6GUQ1 293 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fsd1lQ8BYN5 507 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arhgef28P97433 1693 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mars2Q499X9 586 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dpf2Q61103 391 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nlrp9cQ66X01 1004 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slitrk2Q810C0 846 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc137Q8R0K4 290 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 AasdhpptQ9CQF6 309 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr706Q9EPF8 316 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 GabrqQ9JLF1 638 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lta4hP24527 611 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Myl2P51667 166 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc16a10Q3U9N9 512 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Epc1Q8C9X6 813 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 TheglQ9DA15 459 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ttll10A4Q9F3 704 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ttc7bE9Q6P5 843 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Abhd12bG3UZN6 359 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Akr1b10G5E895 316 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc1a1P51906 523 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kcnb1Q03717 857 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tbc1d1Q60949 1255 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tas2r131Q7M708 310 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Oxnad1Q8VE38 311 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lpar1P61793 364 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zbtb5Q7TQG0 670 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gadl1Q80WP8 550 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Psmd5Q8BJY1 504 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atp10bB1AWN4 1474 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 CratP47934 626 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tubgcp3P58854 905 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Casp4P70343 373 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Msx3P70354 204 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trim36Q80WG7 729 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dennd5bA2RSQ0 1274 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ppef2O35385 757 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Spg21Q9CQC8 308 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ppp2r3dQ9Z176 491 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 RpsaP14206 295 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pcdhb19Q91Y01 801 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Unc45aQ99KD5 944 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cyb561d2Q9WUE3 222 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tex28B1AYN9 409 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Itga4Q00651 1039 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tshz1Q5DTH5 1084 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ino80dQ66JY2 873 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rassf6Q80UQ2 353 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Git1Q68FF6 770 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atl2Q6PA06 583 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q9D2Q3 444 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cables1Q9ESJ1 568 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Usp31E9Q6Y8 1344 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atp6v1b2P62814 511 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 LbpQ61805 481 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 3830417A13RikQ8BQJ2 303 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NarfQ9CYQ7 462 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cdc42ep4Q9JM96 349 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 2010300C02RikE9Q3M9 1175 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Il1rl1P14719 567 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trmt10aQ8C1Z8 328 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ddi1Q9DAF3 408 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hecw2Q6I6G8 1578 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Erich1E9PY43 332 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Traf2P39429 501 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 AaasP58742 546 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kctd19Q562E2 927 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Abcg4Q91WA9 646 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nipsnap3bQ9CQE1 247 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gprc5dQ9JIL6 344 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp882E9Q4R4 555 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Efcab8Q8C9R9 203 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arfip2Q8K221 341 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pdcd7Q9WTY1 482 aa18.12■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm7275E9Q1B3 247 aa18.11■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ptgs2Q05769 604 aa18.11■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Phactr4Q501J7 694 aa18.11■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr389Q7TRX7 312 aa18.11■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ckap2lQ7TS74 745 aa18.11■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Irs2P81122 1321 aa18.11■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Magea4F2Z493 315 aa18.11■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tex11Q14AT2 947 aa18.11■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sarm1Q6PDS3 724 aa18.11■□□□□ 0.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nlrp4bQ8C6J9 863 aa18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27 ms