RNA–Protein interactions for RNA: YNL296W

YNL296W, Transcript of Dubious open reading frame unlikely to encode a functional protein, yeast

Gene YNL296W, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL296W	YNL296W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YNL296W	YNL296W	RIB5	P38145	238 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YNL296W	YNL296W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YNL296W	YNL296W	YER076C	P40049	302 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YNL296W	YNL296W	YGR026W	P53217	278 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YNL296W	YNL296W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YNL296W	YNL296W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YNL296W	YNL296W	ECM12	O13529	151 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	MRPS9	P38120	278 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	DXO1	Q06349	442 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	YBR292C	P38357	123 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	YFR045W	P43617	309 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	SDS23	P53172	527 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	YCL001W-A	P87012	153 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	YOR105W	Q08504	108 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	ENV10	Q99382	181 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	YHR140W	P38842	239 aa		3	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	YKE4	P40544	346 aa		3	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	TVP18	Q04767	167 aa		3	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	MRPS16	Q02608	121 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	YKL070W	P36087	169 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	2.98	□□□□□ -1.93	not detected
YNL296W	YNL296W	YIL163C	P40448	117 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	YIL024C	P40543	189 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	UBC4	P15731	148 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	MSK1	P32048	576 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	YBR209W	P38311	105 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	CYB5	P40312	120 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	ATP19	P81451	68 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	CSM4	Q08955	156 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL296W	YNL296W	YLR156W	P0CE96	114 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	YLR159W	P0CE97	114 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	YLR161W	P0CE98	114 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	DCV1	P43595	202 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	YOR015W	Q12169	119 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	YLR118C	Q12354	227 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	ACB1	P31787	87 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	FZF1	P32805	299 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	VMA7	P39111	118 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	SRB7	P47822	140 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	LAC1	P28496	418 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	YFL019C	P43576	117 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	MOG1	P47123	218 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	GPI19	Q04082	140 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	YER085C	P40058	173 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	CWP2	P43497	92 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	YGL088W	P53151	121 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	PAU4	P53427	120 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	ADD37	Q03233	198 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	YOR268C	Q08734	132 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	AIM29	P36154	155 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	RPB11	P38902	120 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	YAR029W	P39549	74 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	ANT1	Q06497	328 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YNL296W	YNL296W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	PAU1	P0CE88	120 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	PAU14	P0CE89	120 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	PAU6	P0CE90	120 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	PAU18	P0CE91	120 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	PAU8	P0CE92	120 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	PAU11	P0CE93	120 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	YBR090C	P38253	122 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	PAU13	P38725	120 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	TAD2	P47058	250 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	PAU10	Q03050	120 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	YDL241W	Q07738	123 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	PAU20	Q08322	120 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	PAU9	Q3E770	120 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	TRP1	P00912	224 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	ZRT1	P32804	376 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	SPC25	P40014	221 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	NAT3	Q06504	195 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	AQY2	P0CD90	149 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	YBR219C	P38317	127 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YNL296W	YNL296W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	2.88	□□□□□ -1.95

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.1 ms