RNA–Protein interactions for RNA: YDR223W

CRF1, Transcript of Transcriptional corepressor, yeast

Gene CRF1, Length 1,404 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CRF1	YDR223W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	VAR1	P02381	398 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	QRI5	P32344	111 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	FZF1	P32805	299 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	SRP14	P38985	146 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	VMA21	P41806	77 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	MOG1	P47123	218 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	DIA1	P54005	336 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	GIM5	Q04493	163 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	CSM4	Q08955	156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	TIM22	Q12328	207 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	Q0255	P03881	472 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	YGL010W	P25338	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
CRF1	YDR223W	MGA1	P53050	456 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	ZRT1	P32804	376 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	RPB11	P38902	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	YCH1	P42937	148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	YDR366C	P87287	132 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	YCR001W	P25347	104 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	AGA1	P32323	725 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	IRC22	P40006	225 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	PAU15	P40585	124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	YFR035C	P43608	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	YGR026W	P53217	278 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	SGF11	Q03067	99 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	VAM10	Q08474	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	CUP2	P15315	225 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	PAU7	P39545	55 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	PAU5	P43575	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CRF1	YDR223W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	YHR140W	P38842	239 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	DAN1	P47178	298 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	BRP1	P53194	125 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	HAL1	Q01766	294 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	POM33	Q12164	279 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	HAC1	P41546	238 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	YGR017W	P53210	297 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	AIM34	Q03673	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	SUR2	P38992	349 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	RRT13	P40042	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	HHO1	P53551	258 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	GPI19	Q04082	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	GTO3	Q04806	366 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	TRP1	P00912	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	PAM17	P36147	197 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	YPS5	P53057	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	TVP18	Q04767	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	MRPL28	P36527	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	NSE4	P43124	402 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	DXO1	Q06349	442 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	PAU3	P25610	124 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	GTT1	P40582	234 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	TEM1	P38987	245 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	YER085C	P40058	173 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	YNL217W	P40152	326 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	SDS23	P53172	527 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	YLR042C	Q07990	161 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRF1	YDR223W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CRF1	YDR223W	YBR013C	P38215	129 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CRF1	YDR223W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CRF1	YDR223W	YAR1	P46683	200 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CRF1	YDR223W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CRF1	YDR223W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CRF1	YDR223W	KRE9	P39005	276 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CRF1	YDR223W	YIA6	P40556	373 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CRF1	YDR223W	YML108W	Q03759	105 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CRF1	YDR223W	DGA1	Q08650	418 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CRF1	YDR223W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CRF1	YDR223W	YCR023C	P25351	611 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CRF1	YDR223W	YPT53	P36019	220 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CRF1	YDR223W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CRF1	YDR223W	CGR1	P53188	120 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CRF1	YDR223W	PMP3	P87284	55 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CRF1	YDR223W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CRF1	YDR223W	SAL1	D6W196	494 aa		4.48	□□□□□ -1.69

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