RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, human

BASIC

Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRVP-205	ENST00000641549	CYP3A7	P24462	503 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	ATRN	O75882	1429 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	AKR1A1	P14550	325 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	INPP1	P49441	399 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	TTC30A	Q86WT1	665 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	MYOM1	P52179	1685 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	KLHL2	O95198	593 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	RRM1	P23921	792 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	ETFB	P38117	255 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	LY6K	Q17RY6	165 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	SLC12A3	P55017	1021 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	PTK2B	Q14289	1009 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	CCNG2	Q16589	344 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	ZNF280D	Q6N043	979 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	ANO5	Q75V66	913 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	TBCB	Q99426	244 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	CES2	O00748	559 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	NCAM2	O15394	837 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	AKT1	P31749	480 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	HIC1	Q14526	733 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	SLC29A2	Q14542	456 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	E2F4	Q16254	413 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	CPB2	Q96IY4	423 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	TMEM120B	A0PK00	339 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	ANGPT2	O15123	496 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	TWF1	Q12792	350 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	PCSK7	Q16549	785 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	FBXO32	Q969P5	355 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	SLC35C1	Q96A29	364 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	WDR18	Q9BV38	432 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	PKP3	Q9Y446	797 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549		F5H5T6	163 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	PAEP	P09466	180 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	ERVK-9	P63128	1117 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	RNF217	Q8TC41	542 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	TOMM70	O94826	608 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	CXCL8	P10145	99 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	RARG	P13631	454 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	ADORA2A	P29274	412 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	LRRC6	Q86X45	466 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	CASS4	Q9NQ75	786 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549		H0Y3Z8	333 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	IRF1	P10914	325 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	IL10	P22301	178 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRVP-205	ENST00000641549	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17

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