RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639148.1

SLC35A3-215, Transcript of solute carrier family 35 member A3, human

TSL 5

Gene SLC35A3, Length 1,644 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC35A3-215	ENST00000639148	INTS13	Q9NVM9	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	CCP110	O43303	1012 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	LPXN	O60711	386 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	INMT	O95050	263 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	SPDEF	O95238	335 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	CPT1A	P50416	773 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	DGCR2	P98153	550 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	GUCY1B3	Q02153	619 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	HAS1	Q92839	578 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	NELL2	Q99435	816 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	CRB3	Q9BUF7	120 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC35A3-215	ENST00000639148	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	PLA2G6	O60733	806 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	TPH1	P17752	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	KCNA3	P22001	575 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	CD6	P30203	668 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	TEC	P42680	631 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	FOXE3	Q13461	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	SYNE4	Q8N205	404 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	GDF15	Q99988	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	MYL4	P12829	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	PTGS2	P35354	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	ITGA8	P53708	1063 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	SCAP	Q12770	1279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	E2F2	Q14209	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	ICE2	Q659A1	982 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	LENG9	Q96B70	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148		A0A087WV62	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148		A0A087WZ62	844 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC35A3-215	ENST00000639148	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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