RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 PCSK1P29120 753 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 ADSSP30520 456 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 DYMQ7RTS9 669 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 OSTM1Q86WC4 334 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGRF2Q8IZF7 708 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 HVCN1Q96D96 273 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 GCNT4Q9P109 453 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 EXOC7Q9UPT5 735 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 EML5Q05BV3 1969 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 ALDH1A2O94788 518 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 LONP1P36776 959 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 WNT7BP56706 349 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP221Q4G0U5 840 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF720Q7Z2F6 126 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 RASSF3Q86WH2 238 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 BRSK2Q8IWQ3 736 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC52Q8N7C0 313 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB124Q8NES8 71 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 MDGA1Q8NFP4 955 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP17Q9ULZ9 603 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 FRYQ5TBA9 3013 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM208BQ5VWN6 2430 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 HCRTO43612 131 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 OPRD1P41143 372 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 LHX1P48742 406 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE6CP51160 858 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 IRX4P78413 519 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 GRIN1Q05586 938 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1211LQ6NV74 962 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM84AQ96KN4 292 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 PKMYT1Q99640 499 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 SCNM1Q9BWG6 230 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 K7EQS6 105 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP3K13O43283 966 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 GJB2P29033 226 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 C4orf50Q6ZRC1 276 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ARMCX6Q7L4S7 300 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 SPACA7Q96KW9 195 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ACCSQ96QU6 501 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D7Q9P0N9 293 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ITGA11Q9UKX5 1188 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TCHHQ07283 1943 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM8BA6NDV4 472 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ANTXRLA6NF34 631 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 BMP15O95972 392 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM191BP0C7N4 346 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 MAPK8P45983 427 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 RBP5P82980 135 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 CRY1Q16526 586 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM61Q5EBN2 209 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 LPCAT2Q7L5N7 544 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TOP6BLQ8N6T0 577 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 RLN3Q8WXF3 142 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF2CQ99661 725 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA8IPA6NC78 632 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 MYMKA6NI61 221 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA8JA6NMD2 632 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 LEFTY2O00292 366 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TCF3P15923 654 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 DDIT3P35638 169 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNA1Q09470 495 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 LMAN2Q12907 356 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 SYCP3Q8IZU3 236 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA18Q8TC71 538 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 SYT15Q9BQS2 421 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC32A1Q9H598 525 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 GDAP2Q9NXN4 497 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 WASF3Q9UPY6 502 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 GCNT3O95395 438 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 LDHAP00338 332 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ANXA13P27216 316 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 GRIK1P39086 918 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGEA11P43364 429 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 SCARA3Q6AZY7 606 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ALLCQ8N6M5 410 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 MYLPFQ96A32 169 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 MTMR12Q9C0I1 747 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP2C2O75185 946 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP17A1P05093 508 aa29.27■■■□□ 2.28
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