RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP26.27■■□□□ 1.82e-7■□□□□ 8.5
CAPNS1-215ENST00000628018 BADQ92934 168 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR62Q9BZJ7 368 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 CYLDQ9NQC7 956 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 SIGLEC16A6NMB1 481 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 PLA2G4AP47712 749 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 RGS7P49802 495 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPROQ16827 1216 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 MED10Q9BTT4 135 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 GABBR2O75899 941 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 NPR3P17342 541 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 COMTP21964 271 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 PBX3P40426 434 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 SNX16P57768 344 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 FPGSQ05932 587 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 FUT10Q6P4F1 479 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 OTOP2Q7RTS6 562 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM35AQ86V20 835 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 HSFY1Q96LI6 401 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 SELENOOQ9BVL4 669 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.799e-10■■■■□ 24.3
CAPNS1-215ENST00000628018 VWA8A3KMH1 1905 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA8SH3BPF8 625 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 PROSCO94903 275 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 SLU7O95391 586 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT3P12035 628 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 FGFR3P22607 806 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC8A3P57103 927 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM171A1Q5VUB5 890 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 CLEC20AQ6ZU45 233 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 MYLPFQ96A32 169 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 MCEEQ96PE7 176 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM209Q96SK2 561 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 LCMT1Q9UIC8 334 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPRSQ13332 1948 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF185O15231 689 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 BEST1O76090 585 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 FGBP02675 491 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM200BP0CF97 657 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 CXCR5P32302 372 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPY1Q01534 308 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM117BQ6P1L5 589 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 DCUN1D2Q6PH85 259 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRTM3Q86VH5 581 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 C7orf61Q8IZ16 206 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 MYRIPQ8NFW9 859 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 COG1Q8WTW3 980 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 CD101Q93033 1021 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMB7Q99436 277 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 CARD6Q9BX69 1037 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT82Q9NSB4 513 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 TMLHEQ9NVH6 421 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 IP6K2Q9UHH9 426 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 PIK3R2O00459 728 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 EFEMP2O95967 443 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC1A1P43005 524 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 ACADSBP45954 432 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6B2Q6IFH4 312 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF365Q70YC5 407 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 PIGZQ86VD9 579 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 CPNE8Q86YQ8 564 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 CREG2Q8IUH2 290 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 CES2O00748 559 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 MAN1A1P33908 653 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 DNA2P51530 1060 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 JOSD2Q8TAC2 188 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 KCTD13Q8WZ19 329 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 SMARCD1Q96GM5 515 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNK3O14649 394 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 SPOPO43791 374 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 AP1G2O75843 785 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 TERF1P54274 439 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 OGDHQ02218 1023 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 OLFML1Q6UWY5 402 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP57Q86XR8 500 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 FNIP1Q8TF40 1166 aa26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70 ms