RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621217.4

GGA3-222, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 4,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-222ENST00000621217 DCTN3O75935 186 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 ZBED1O96006 694 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 FAM71DQ8N9W8 422 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 ECT2Q9H8V3 914 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 O00370 1275 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 GNAT1P11488 350 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 PDGFRAP16234 1089 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 CHKAP35790 457 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 MAGEA4P43358 317 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 TTC27Q6P3X3 843 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 MPZL3Q6UWV2 235 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 MFSD7Q6UXD7 560 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 FAM71AQ8IYT1 594 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 CFHP08603 1231 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 COMMD10Q9Y6G5 202 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 SMCHD1A6NHR9 2005 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 NDC80O14777 642 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 PLA2G6O60733 806 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 SLC4A1P02730 911 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 GARTP22102 1010 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 ITKQ08881 620 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 KIAA1841Q6NSI8 718 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 SHC3Q92529 594 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 DNPEPQ9ULA0 475 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 KAT6AQ92794 2004 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 A0A1B0GUL6 1792 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 APRTP07741 180 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 STMN1P16949 149 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 ITIH2P19823 946 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 ABCD1P33897 745 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 PCYT1AP49585 367 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 BCAR1P56945 870 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 OVGP1Q12889 678 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 HIF1AQ16665 826 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 QPCTQ16769 361 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 DCAF12L1Q5VU92 463 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 MAML1Q92585 1016 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 ARHGAP10A1A4S6 786 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 RIPK2O43353 540 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 AGTP01019 485 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 MAPTP10636 758 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 RBP3P10745 1247 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 GHRP10912 638 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 ELNP15502 786 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 TAS2R40P59535 323 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 RBP5P82980 135 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 AGBL2Q5U5Z8 902 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 TMEM154Q6P9G4 183 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 LONP2Q86WA8 852 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 NETO2Q8NC67 525 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 HIC2Q96JB3 615 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 TRABDQ9H4I3 376 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 DPP3Q9NY33 737 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 KNL1Q8NG31 2342 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 LACTBL1A8MY62 500 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 B3GAT3O94766 335 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 CPP00450 1065 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 CST3P01034 146 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 MUTP22033 750 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 SNX16P57768 344 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 CXorf38Q8TB03 319 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 SPATA18Q8TC71 538 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 TMC2Q8TDI7 906 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 SMYD2Q9NRG4 433 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 CASTOR2A6NHX0 329 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 PROSCO94903 275 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms