RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 ATP2C2O75185 946 aa26.7■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 AKAP3O75969 853 aa26.7■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 USP4Q13107 963 aa26.7■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC65Q8IXS2 484 aa26.7■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 OR5B17Q8NGF7 314 aa26.7■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa26.7■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 HPDLQ96IR7 371 aa26.7■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 EPN2O95208 641 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC192P0DO97 292 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 LAMA1P25391 3075 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 LMO2P25791 158 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 C4orf50Q6ZRC1 276 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 FSIP1Q8NA03 581 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 GLIS3Q8NEA6 775 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 ATP2A3Q93084 1043 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 CDH9Q9ULB4 789 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 WNT6Q9Y6F9 365 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF233A6NK53 670 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF806P0C7X5 589 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 IFNAR2P48551 515 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 LIMK1P53667 647 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 SURF1Q15526 300 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 DUOXA2Q1HG44 320 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 EML3Q32P44 896 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 CBWD2Q8IUF1 395 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 PDILTQ8N807 584 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 TTC16Q8NEE8 873 aa26.68■■□□□ 1.86
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PTPRF-216ENST00000617451 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA17Q96L03 361 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 SYT15Q9BQS2 421 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 MTMR6Q9Y217 621 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 GREB1Q4ZG55 1949 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 C2orf78A6NCI8 922 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 TNNC2P02585 160 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 TCF3P15923 654 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 HOXD13P35453 343 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
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PTPRF-216ENST00000617451 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 SYT13Q7L8C5 426 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 SH3RF2Q8TEC5 729 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 CD101Q93033 1021 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 HPS3Q969F9 1004 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 MYLPFQ96A32 169 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 HHIPQ96QV1 700 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 CRTAC1Q9NQ79 661 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 HDCP19113 662 aa26.66■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 KCNB1Q14721 858 aa26.66■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 CEP295NLQ96MC4 621 aa26.66■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 TNMDQ9H2S6 317 aa26.66■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 HSPBP1Q9NZL4 362 aa26.66■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa26.66■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa26.66■■□□□ 1.86
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PTPRF-216ENST00000617451 NASPP49321 788 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 NR1H3Q13133 447 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 PLA2G2CQ5R387 149 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 WDR49Q8IV35 697 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 LINC00597Q9H2U6 94 aa26.65■■□□□ 1.86
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PTPRF-216ENST00000617451 KBTBD4Q9NVX7 518 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 EML5Q05BV3 1969 aa26.64■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 PDGFRBP09619 1106 aa26.64■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 GRIK1P39086 918 aa26.64■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 PDE6CP51160 858 aa26.64■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 E2F4Q16254 413 aa26.64■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 PLK5Q496M5 336 aa26.64■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 IL31Q6EBC2 164 aa26.64■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC27Q9C0I9 530 aa26.64■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 EBF1Q9UH73 591 aa26.64■■□□□ 1.86
PTPRF-216ENST00000617451 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
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PTPRF-216ENST00000617451 APBB3O95704 486 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 PFKLP17858 780 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 USP46P62068 366 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 ZXDBP98169 803 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 DMC1Q14565 340 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 ACDQ96AP0 544 aa26.63■■□□□ 1.85
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