RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616702.1

CCL3L3-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 2

Gene CCL3L3, Length 548 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-202ENST00000616702 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 OBP2AQ9NY56 170 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 COL4A3Q01955 1670 aa14.52□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 LAMTOR5O43504 91 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 FAM163BP0C2L3 166 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 NR2F2P24468 414 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 CCNE1P24864 410 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 WEE1P30291 646 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 MAGEA11P43364 429 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 CDH8P55286 799 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 CLDN10P78369 228 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 KCNB1Q14721 858 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 VSTM1Q6UX27 236 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 TMEM150AQ86TG1 271 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 TMEM174Q8WUU8 243 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 DPEP3Q9H4B8 488 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 PROB1E7EW31 1015 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 ARNTLO00327 626 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 TRIM66O15016 1216 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 P4HA1P13674 534 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 MAGEA9P43362 315 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 RAP1GAPP47736 663 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 SOX9P48436 509 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 ADAM9Q13443 819 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 PNOCQ13519 176 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 MON1AQ86VX9 555 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 TMC2Q8TDI7 906 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 MYRFLQ96LU7 910 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 SMYD3Q9H7B4 428 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 MMRN2Q9H8L6 949 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 TDP1Q9NUW8 608 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 RMND1Q9NWS8 449 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 GTSE1Q9NYZ3 720 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 NME7Q9Y5B8 376 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 R4GN57 208 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 TCHHQ07283 1943 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 SHISA7A6NL88 538 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 AKAP3O75969 853 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 VNN1O95497 513 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 CKMP06732 381 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 SP9P0CG40 484 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 KRT13P13646 458 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 PIK3CAP42336 1068 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 VAMP7P51809 220 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 PLCB2Q00722 1185 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 TNK2Q07912 1038 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 SV2AQ7L0J3 742 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 CLDN23Q96B33 292 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 MSANTD3Q96H12 275 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 SPATA17Q96L03 361 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 GKN1Q9NS71 199 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 CCL26Q9Y258 94 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 PRR23AA6NEV1 266 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 SOBPA7XYQ1 873 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 F8VP50 259 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 CLDN5O00501 218 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 IKBKBO14920 756 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 TADA3O75528 432 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 ABL1P00519 1130 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 USP17L7P0C7H9 530 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 RPS9P46781 194 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 GCLMP48507 274 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 FZD5Q13467 585 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 NFIL3Q16649 462 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 ZACNQ401N2 412 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-202ENST00000616702 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms