RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616206.4

PDE4DIP-241, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDE4DIP, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-241ENST00000616206 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 DNAH12Q6ZR08 3092 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 ELP1O95163 1332 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRSS38A1L453 326 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 CCDC154A6NI56 674 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 WASH4PA8MWX3 477 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 SLC27A2O14975 620 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZBTB5O15062 677 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 TIMM44O43615 452 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 DGKIO75912 1065 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 CABYRO75952 493 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 RHOBTB3O94955 611 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 TXNP10599 105 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 SRFP11831 508 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 CST5P28325 142 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 KIF5BP33176 963 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 MCM5P33992 734 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 BCAR1P56945 870 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 PSMC6P62333 389 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 CDK17Q00537 523 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRAF1Q13077 416 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 ITGA7Q13683 1181 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 GRM4Q14833 912 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 SNX17Q15036 470 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 EPHA7Q15375 998 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 SHHQ15465 462 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 NFKBIBQ15653 356 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 STXBP2Q15833 593 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 DUSP28Q4G0W2 176 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 CCDC38Q502W7 563 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 BMP2KLQ5H9B9 411 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 FIGNQ5HY92 759 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 DGKKQ5KSL6 1271 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 NLGN4XQ8N0W4 816 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 C7orf31Q8N865 590 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 CCDC89Q8N998 374 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 DNERQ8NFT8 737 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 SCFD2Q8WU76 684 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 RAX2Q96IS3 184 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 TAAR1Q96RJ0 339 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 PIGSQ96S52 555 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 MYL10Q9BUA6 226 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 CEP41Q9BYV8 373 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 POFUT1Q9H488 388 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 EPB41L1Q9H4G0 881 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 RRN3Q9NYV6 651 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 ADGRE2Q9UHX3 823 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF281Q9Y2X9 895 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 MROH7Q68CQ1 1323 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 M0R3H8 397 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 CTAGE5O15320 804 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 APOL3O95236 402 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 POLR2MP0CAP2 368 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 CPT1AP50416 773 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 CASP5P51878 434 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 MAPK10P53779 464 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 ANTXR2P58335 489 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 FPGSQ05932 587 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 MUM1Q2TAK8 710 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 HYIQ5T013 277 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZPBP2Q6X784 338 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 MAEAQ7L5Y9 396 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 PHKBQ93100 1093 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 TOX2Q96NM4 488 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 LRRC2Q9BYS8 371 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRDM12Q9H4Q4 367 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 IFT122Q9HBG6 1241 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 GULP1Q9UBP9 304 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PDE4DIP-241ENST00000616206 Q9Y3F1 56 aa8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms