RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	TXNDC8	Q6A555	127 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	CPA6	Q8N4T0	437 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	TTC8	Q8TAM2	541 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMC2	Q8TDI7	906 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	TAF4B	Q92750	862 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPATA17	Q96L03	361 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	MYRFL	Q96LU7	910 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	PKMYT1	Q99640	499 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHRD	Q9H2X0	955 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	GKN1	Q9NS71	199 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	RMND1	Q9NWS8	449 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	IKBKB	O14920	756 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	HCRT	O43612	131 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATP2C2	O75185	946 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	RHOBTB3	O94955	611 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF202	O95125	648 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMC2	O95347	1197 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	ABL1	P00519	1130 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	PFKL	P17858	780 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	HDC	P19113	662 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	NR2F2	P24468	414 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	CTH	P32929	405 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	PIK3CA	P42336	1068 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	MTAP	Q13126	283 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	RUNX3	Q13761	415 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	STKLD1	Q8NE28	680 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	RUBCN	Q92622	972 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCED1B	Q96HM7	432 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	C8orf48	Q96LL4	319 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	DMAC2	Q9NW81	257 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	NCDN	Q9UBB6	729 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	ARNTL	O00327	626 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATG13	O75143	517 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	SOX9	P48436	509 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	CASP4	P49662	377 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	VAMP7	P51809	220 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	MTF1	Q14872	753 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	PON2	Q15165	354 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATP2A3	Q93084	1043 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	TSG101	Q99816	390 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	CACNA1H	O95180	2353 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	NOTCH4	Q99466	2003 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197		F8VP50	259 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAPK13	O15264	365 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	STX10	O60499	249 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	ABCB7	O75027	752 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRR29	P0C7W0	189 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHRNB1	P11230	501 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	YWHAQ	P27348	245 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	CLDN10	P78369	228 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	TNK2	Q07912	1038 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	DPYD	Q12882	1025 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADAM9	Q13443	819 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC142	Q17RM4	750 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPIPB4-222	ENST00000614197	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54

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