RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 MKNK1Q9BUB5 465 aa9.56□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9.56□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.56□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 PTPRHQ9HD43 1115 aa9.56□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 SLC38A7Q9NVC3 462 aa9.56□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 GTSE1Q9NYZ3 720 aa9.56□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 CNTN3Q9P232 1028 aa9.56□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 NUB1Q9Y5A7 615 aa9.56□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 SPAG17Q6Q759 2223 aa9.56□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 K7ERI5 159 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 EXTL3O43909 919 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 RPA1P27694 616 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 HOXA6P31267 233 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 RPL9P32969 192 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 MCM4P33991 863 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 MCM7P33993 719 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 PXNP49023 591 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 PON2Q15165 354 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 PCSK7Q16549 785 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 DGKKQ5KSL6 1271 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 KBTBD6Q86V97 674 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 YAF2Q8IY57 180 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 DAW1Q8N136 415 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 NECAB1Q8N987 351 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 WASF1Q92558 559 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 IFT74Q96LB3 600 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 PGLYRP2Q96PD5 576 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 BHMT2Q9H2M3 363 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 SMOC1Q9H4F8 434 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa9.55□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 FRYQ5TBA9 3013 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 JAK2O60674 1132 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 EPN2O95208 641 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 PRAMEF12O95522 483 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 ZNF806P0C7X5 589 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 HARSP12081 509 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 PROZP22891 400 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 RAP1GAPP47736 663 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 NPTX2P47972 431 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 PEX3P56589 373 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 TNK2Q07912 1038 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 SEZ6Q53EL9 994 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 STPG1Q5TH74 334 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 C1orf228Q6PIY5 440 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 GAREM2Q75VX8 874 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 TTC9BQ8N6N2 239 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 APPL2Q8NEU8 664 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 GAB3Q8WWW8 586 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 KIFAP3Q92845 792 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 E2F7Q96AV8 911 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 ACAP3Q96P50 834 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 GPR88Q9GZN0 384 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 MAFFQ9ULX9 164 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 CITO14578 2027 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 IGF2RP11717 2491 aa9.54□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 CCDC169A6NNP5 214 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 RPP40O75818 363 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 SOAT2O75908 522 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 KCNK5O95279 499 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 PROS1P07225 676 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 OR52Z1P0C646 297 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 C1QTNF9P0C862 333 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 MCF2P10911 925 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 EPB42P16452 691 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 NFKB1P19838 968 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 SPAG1Q07617 926 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 DUSP4Q13115 394 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 MAPK7Q13164 816 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 ME3Q16798 604 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 TCEAL6Q6IPX3 200 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 MPZL3Q6UWV2 235 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 ERMNQ8TAM6 284 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 TCEAL3Q969E4 200 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms