RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607519.1

GMDS-AS1-216, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 579 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-216ENST00000607519 THAP12O43422 761 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AP1G2O75843 785 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PAEPP09466 180 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KCNA5P22460 613 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GNA15P30679 374 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 STAT1P42224 750 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RGS7P49802 495 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ADKP55263 362 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 USP46P62068 366 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TFF2Q03403 129 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 COL19A1Q14993 1142 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CNGA2Q16280 664 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SGO2Q562F6 1265 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PPM1LQ5SGD2 360 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ARHGAP17Q68EM7 881 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 POTEHQ6S545 545 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DNAAF5Q86Y56 855 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PASD1Q8IV76 773 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 WDTC1Q8N5D0 677 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SCAMP5Q8TAC9 235 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CASP10Q92851 521 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PPP2R3CQ969Q6 453 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPAG5Q96R06 1193 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PCDHB18PQ96TA0 734 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GRPEL1Q9HAV7 217 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRT82Q9NSB4 513 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CYTH4Q9UIA0 394 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TSPAN16Q9UKR8 245 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CAPN11Q9UMQ6 739 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C2orf16Q68DN1 1984 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EYSQ5T1H1 3165 aa11.12□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GREB1Q4ZG55 1949 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GRXCR2A6NFK2 248 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC38A8A6NNN8 435 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HHLA1C9JL84 531 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ABCB7O75027 752 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MMEP08473 750 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CYP11B1P15538 503 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GJA1P17302 382 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PGFP49763 221 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PDE4CQ08493 712 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ARID5BQ14865 1188 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LIN9Q5TKA1 542 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LCLAT1Q6UWP7 414 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C4orf50Q6ZRC1 276 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CLEC20AQ6ZU45 233 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TTC39CQ8N584 583 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPC24Q8NBT2 197 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OLIG1Q8TAK6 271 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPPL2BQ8TCT7 592 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MSLNLQ96KJ4 702 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAM81BQ96LP2 452 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NUP58Q9BVL2 599 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DUSP16Q9BY84 665 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TJP2Q9UDY2 1190 aa11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ITIH6Q6UXX5 1313 aa11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 M0QYV0 167 aa11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TPM3P06753 285 aa11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAM200BP0CF97 657 aa11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRT9P35527 623 aa11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MAGEA11P43364 429 aa11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ALDH1A3P47895 512 aa11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TUFMP49411 452 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FMO1Q01740 532 aa11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PTK2Q05397 1052 aa11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ASIC2Q16515 512 aa11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CFAP221Q4G0U5 840 aa11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PKDCCQ504Y2 493 aa11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FIGNQ5HY92 759 aa11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SFMBT2Q5VUG0 894 aa11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PMF1Q6P1K2 205 aa11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ANKRD52Q8NB46 1076 aa11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms