RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598960.5

FCHO1-227, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-227ENST00000598960 CPNE8Q86YQ8 564 aa14.92□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 CREG2Q8IUH2 290 aa14.92□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 TMEM199Q8N511 208 aa14.92□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 PBKQ96KB5 322 aa14.92□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 MCEEQ96PE7 176 aa14.92□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 ACBD6Q9BR61 282 aa14.92□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 SELENOOQ9BVL4 669 aa14.92□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 CYLDQ9NQC7 956 aa14.92□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 ST7Q9NRC1 585 aa14.92□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 MARCH5Q9NX47 278 aa14.92□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 CTAGE15A4D2H0 777 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 KCNK3O14649 394 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 NRP1O14786 923 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 SYN3O14994 580 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 EFCAB14O75071 495 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 CTAGE8P0CG41 777 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 NPR3P17342 541 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 PLA2G4AP47712 749 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 SNX16P57768 344 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 TMEM110Q86TL2 294 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 CTAGE6Q86UF2 777 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 CTAGE4Q8IX94 777 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 THEM5Q8N1Q8 247 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 OR10T2Q8NGX3 314 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 FNIP1Q8TF40 1166 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 PKMYT1Q99640 499 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 COLEC11Q9BWP8 271 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 DUSP16Q9BY84 665 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 B3GNT5Q9BYG0 378 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 KRT82Q9NSB4 513 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 RNF14Q9UBS8 474 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 IP6K2Q9UHH9 426 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 ADAM28Q9UKQ2 775 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.91□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 CLDN5O00501 218 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 TRAPPC3O43617 180 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 TADA2AO75478 443 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 GABBR2O75899 941 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 DGKIO75912 1065 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 BAIAP3O94812 1187 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 AMHP03971 560 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 FAM200BP0CF97 657 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 ACADSBP45954 432 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 MARCKSL1P49006 195 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 TSPY1Q01534 308 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 OGDHQ02218 1023 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 OR6B2Q6IFH4 312 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 FAM171BQ6P995 826 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 UBL4BQ8N7F7 174 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 NIPA2Q8N8Q9 360 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 JOSD2Q8TAC2 188 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 ALG3Q92685 438 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 KRT35Q92764 455 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 MYLPFQ96A32 169 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 PCED1BQ96HM7 432 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 HSFY1Q96LI6 401 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 MED10Q9BTT4 135 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 CARD9Q9H257 536 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 FAN1Q9Y2M0 1017 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-227ENST00000598960 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 44.6
FCHO1-227ENST00000598960 CCDC66A2RUB6 948 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 UPP2O95045 317 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 GALTP07902 379 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 KRT3P12035 628 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 SCNN1AP37088 669 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 BCAR1P56945 870 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 SLC8A3P57103 927 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 DEFB103AP81534 67 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 ITIH3Q06033 890 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 CCDC181Q5TID7 509 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 FUT10Q6P4F1 479 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 OLFML1Q6UWY5 402 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 GOLGA1Q92805 767 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-227ENST00000598960 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms