RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 IFNKQ9P0W0 207 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 GCNT4Q9P109 453 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGEF37A1IGU5 675 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 GDF9O60383 454 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 ASS1P00966 412 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 PROS1P07225 676 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 CLCNKBP51801 687 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 USP41Q3LFD5 358 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR44Q5JSH3 913 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 PRR23BQ6ZRT6 265 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 EHBP1Q8NDI1 1231 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 B3GALT6Q96L58 329 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM81BQ96LP2 452 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 P4HA1P13674 534 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 GSE1Q14687 1217 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF699Q32M78 642 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 IL31Q6EBC2 164 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 HPDLQ96IR7 371 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 IER2Q9BTL4 223 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 XYLT2Q9H1B5 865 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 F5P12259 2224 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 F8W810 466 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 TRAPPC3O43617 180 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 B3GAT3O94766 335 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 CST3P01034 146 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 RPL17P18621 184 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 MYL6P60660 151 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 ITFG1Q8TB96 612 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM84AQ96KN4 292 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR62Q9BZJ7 368 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM5Q9C035 493 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 CHRDQ9H2X0 955 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXW11Q9UKB1 542 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 SHISA7A6NL88 538 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 ZZEF1O43149 2961 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 NOP14P78316 857 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 PLCB2Q00722 1185 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF667Q5HYK9 610 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 FUT10Q6P4F1 479 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF687Q8N1G0 1237 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 LMO3Q8TAP4 145 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 IQCDQ96DY2 449 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 NT5C1BQ96P26 610 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 PLCB1Q9NQ66 1216 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 HEBP1Q9NRV9 189 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 GDAP2Q9NXN4 497 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 NUB1Q9Y5A7 615 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 ECI2O75521 394 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 PON1P27169 355 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 HOXA9P31269 272 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 LILRA4P59901 499 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 SYCP1Q15431 976 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 PPM1LQ5SGD2 360 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 LIN9Q5TKA1 542 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM65Q6PJ69 517 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 SEMA4DQ92854 862 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAM28Q9UKQ2 775 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 SIK3Q9Y2K2 1263 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 KPNA7A9QM74 516 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 PPEF2O14830 753 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 TEX33O43247 280 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 XYLBO75191 536 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 TADA2AO75478 443 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF4AO95239 1232 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM163BP0C2L3 166 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 CCR3P51677 355 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 LIMK1P53667 647 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 TNNC1P63316 161 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNMA1Q12791 1236 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 DPH6Q7L8W6 267 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATA18Q8TC71 538 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 PAAF1Q9BRP4 392 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 CRACR2AQ9BSW2 395 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 NIF3L1Q9GZT8 377 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.629e-10■■■■□ 24.3
CAPNS1-214ENST00000592483 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 MAN2B1O00754 1011 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 TM4SF5O14894 197 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 PBX1P40424 430 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 NPAS3Q8IXF0 933 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 TTC39CQ8N584 583 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 JAKMIP2Q96AA8 810 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 SUSD3Q96L08 255 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 APEX2Q9UBZ4 518 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXL5Q9UKA1 691 aa25.17■■□□□ 1.62
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