RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 GSDMAQ96QA5 445 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 NELL2Q99435 816 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 PKMYT1Q99640 499 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 MED10Q9BTT4 135 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 SLC46A2Q9BY10 475 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 BCO2Q9BYV7 579 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 IMPG2Q9BZV3 1241 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 TRPV4Q9HBA0 871 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 TRPC7Q9HCX4 862 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 FANCMQ8IYD8 2048 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 MAN2B1O00754 1011 aa8.87□□□□□ -0.99
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PTPRM-214ENST00000583153 CETN3O15182 167 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 MAPK13O15264 365 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 ABL1P00519 1130 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 HLA-DRAP01903 254 aa8.87□□□□□ -0.99
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PTPRM-214ENST00000583153 TRIM49P0CI25 452 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM49CP0CI26 452 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 EPB41P11171 864 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
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PTPRM-214ENST00000583153 GCLMP48507 274 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 NLRP12P59046 1061 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 CLDN10P78369 228 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 STIM1Q13586 685 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 ANGPT1Q15389 498 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 NFIL3Q16649 462 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 ZACNQ401N2 412 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 TXNDC8Q6A555 127 aa8.87□□□□□ -0.99
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PTPRM-214ENST00000583153 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 CMTM8Q8IZV2 173 aa8.87□□□□□ -0.99
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PTPRM-214ENST00000583153 TTC8Q8TAM2 541 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 BPIFB1Q8TDL5 484 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM174Q8WUU8 243 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 TAF4BQ92750 862 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 TNIP3Q96KP6 325 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 TIGD1Q96MW7 591 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 PHOX2BQ99453 314 aa8.87□□□□□ -0.99
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PTPRM-214ENST00000583153 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 HELZP42694 1942 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 CLDN5O00501 218 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM66O15016 1216 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 CHADO15335 359 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 LRRN2O75325 713 aa8.86□□□□□ -0.99
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PTPRM-214ENST00000583153 VNN1O95497 513 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 CCNE1P24864 410 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 CLCN1P35523 988 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 MAGEA11P43364 429 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 MRE11P49959 708 aa8.86□□□□□ -0.99
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PTPRM-214ENST00000583153 EDRF1Q3B7T1 1238 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 TCERG1LQ5VWI1 586 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 SPOPLQ6IQ16 392 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 ACOT1Q86TX2 421 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 FAM3CQ92520 227 aa8.86□□□□□ -0.99
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PTPRM-214ENST00000583153 ZFYVE19Q96K21 471 aa8.86□□□□□ -0.99
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PTPRM-214ENST00000583153 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 ELOVL4Q9GZR5 314 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 DNAI2Q9GZS0 605 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 LTB4R2Q9NPC1 389 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 GKN1Q9NS71 199 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 OBP2AQ9NY56 170 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-214ENST00000583153 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
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