RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 NDUFV1P49821 464 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 ZNF134P52741 427 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 GUCY1B3Q02153 619 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 TUBA3CQ13748 450 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 GEN1Q17RS7 908 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 INSCQ1MX18 579 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 CASC1Q6TDU7 716 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 RNF44Q7L0R7 432 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 BEND5Q7L4P6 421 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 YAF2Q8IY57 180 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 SYNE4Q8N205 404 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 GPR20Q99678 358 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 STK31Q9BXU1 1019 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 AS3MTQ9HBK9 375 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 INTS13Q9NVM9 706 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 F5H697 171 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 RASSF9O75901 435 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 SPDEFO95238 335 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 FGFR2P21802 821 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 IL1R2P27930 398 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 DGKEP52429 567 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 TERF1P54274 439 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 LILRA4P59901 499 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 SLC29A2Q14542 456 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 NPY5RQ15761 445 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 TTC30BQ8N4P2 665 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.69□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 A0A0B4J269 797 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 A1BGP04217 495 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 SRGNP10124 158 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 DGCR2P98153 550 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 SCAPQ12770 1279 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 TUBB3Q13509 450 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 ARHGEF7Q14155 803 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 SPRED1Q7Z699 444 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 MRGPREQ86SM8 312 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 ZNF280BQ86YH2 543 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 MYRIPQ8NFW9 859 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 CERS4Q9HA82 394 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 ZNF212Q9UDV6 495 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 MID2Q9UJV3 735 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.68□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 ACVR2AP27037 513 aa6.67□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 KRT17Q04695 432 aa6.67□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 MYO1EQ12965 1108 aa6.67□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 TP53BP2Q13625 1128 aa6.67□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.67□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 LCE4AQ5TA78 99 aa6.67□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.67□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 KRT28Q7Z3Y7 464 aa6.67□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 GPR149Q86SP6 731 aa6.67□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 LNX2Q8N448 690 aa6.67□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 GDF15Q99988 308 aa6.67□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.67□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.67□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 DKK4Q9UBT3 224 aa6.67□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 PIPSLA2A3N6 862 aa6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 UNC119BA6NIH7 251 aa6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 TTC36A6NLP5 189 aa6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 B8ZZF3 427 aa6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 LPXNO60711 386 aa6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms