RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580419.5

SMARCE1-216, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCE1, Length 1,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-216ENST00000580419 ATG13O75143 517 aa15.49■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 TADA3O75528 432 aa15.49■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 KIF20AO95235 890 aa15.49■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 USP17L7P0C7H9 530 aa15.49■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 ID4P47928 161 aa15.49■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 RUNX3Q13761 415 aa15.49■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 GAS6Q14393 721 aa15.49■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 NFIL3Q16649 462 aa15.49■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 DDR2Q16832 855 aa15.49■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 FBXO43Q4G163 708 aa15.49■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 MAB21L3Q8N8X9 362 aa15.49■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 CCDC26Q8TAB7 109 aa15.49■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 PARD3BQ8TEW8 1205 aa15.49■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 XYLT2Q9H1B5 865 aa15.49■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa15.49■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa15.49■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 K7ESF4 209 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 CST3P01034 146 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 RPN1P04843 607 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 DLATP10515 647 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 DRD1P21728 446 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 LMO2P25791 158 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 USP4Q13107 963 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 CUL4BQ13620 913 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 ZNF77Q15935 545 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 TXNDC8Q6A555 127 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 SCARA3Q6AZY7 606 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 LAIR1Q6GTX8 287 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 TXNDC11Q6PKC3 985 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 TMC2Q8TDI7 906 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 OVCA2Q8WZ82 227 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 TAF4BQ92750 862 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 PCED1BQ96HM7 432 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 ELOVL4Q9GZR5 314 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 CRTAC1Q9NQ79 661 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 HPS4Q9NQG7 708 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 DLL3Q9NYJ7 618 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 EXOC3O60645 756 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 OLFM2O95897 454 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 TNNC1P63316 161 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 ARHGAP8P85298 464 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 WDR72Q3MJ13 1102 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 WDR44Q5JSH3 913 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 LONP2Q86WA8 852 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 CPA6Q8N4T0 437 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 OSCP1Q8WVF1 389 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 ZNF516Q92618 1163 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 ATP2A3Q93084 1043 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 MYLPFQ96A32 169 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 PAGE5Q96GU1 130 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 FAXDC2Q96IV6 333 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 MMS19Q96T76 1030 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 SNX25Q9H3E2 840 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 KCTD10Q9H3F6 313 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 SLC39A2Q9NP94 309 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 COMMD8Q9NX08 183 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 CCL26Q9Y258 94 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 CLIC2O15247 247 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 AKAP3O75969 853 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 ANXA13P27216 316 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 GPR15P49685 360 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 CYP2J2P51589 502 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 KRT85P78386 507 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 SLC7A9P82251 487 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 LMNB2Q03252 620 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 TNK2Q07912 1038 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 STK4Q13043 487 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 TRPC3Q13507 836 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 PKP1Q13835 747 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 MTF1Q14872 753 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 SNX30Q5VWJ9 437 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 CAMKK1Q8N5S9 505 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 KIAA0895Q8NCT3 520 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 ZFYVE19Q96K21 471 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 BLZF1Q9H2G9 400 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 EXOC1Q9NV70 894 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 IL37Q9NZH6 218 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 NCDNQ9UBB6 729 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 RAB23Q9ULC3 237 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 ATG2BQ96BY7 2078 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
SMARCE1-216ENST00000580419 A0A1W2PQ27 194 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms