RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579815.1

CLTC-211, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 5

Gene CLTC, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-211ENST00000579815 USP37Q86T82 979 aa6.79□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 IFT20Q8IY31 132 aa6.79□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 SYCP3Q8IZU3 236 aa6.79□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 MREGQ8N565 214 aa6.79□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 ACTRT1Q8TDG2 376 aa6.79□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 PIGOQ8TEQ8 1089 aa6.79□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.79□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 JDP2Q8WYK2 163 aa6.79□□□□□ -1.32
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CLTC-211ENST00000579815 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
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CLTC-211ENST00000579815 TAOK3Q9H2K8 898 aa6.79□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.79□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 AS3MTQ9HBK9 375 aa6.79□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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CLTC-211ENST00000579815 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.79□□□□□ -1.32
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CLTC-211ENST00000579815 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.79□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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CLTC-211ENST00000579815 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.79□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 ADAM21Q9UKJ8 722 aa6.79□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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CLTC-211ENST00000579815 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
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CLTC-211ENST00000579815 MYPNQ86TC9 1320 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.78□□□□□ -1.32
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CLTC-211ENST00000579815 H0YCG3 227 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 CLIC2O15247 247 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 EXOC3O60645 756 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 RPS6KA5O75582 802 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 ZNF205O95201 554 aa6.78□□□□□ -1.32
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CLTC-211ENST00000579815 ACTN1P12814 892 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 CASP4P49662 377 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 RARRES1P49788 294 aa6.78□□□□□ -1.32
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CLTC-211ENST00000579815 PPFIA1Q13136 1202 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 KIF22Q14807 665 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 PGM5Q15124 567 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 TCEAL1Q15170 157 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 RTP2Q5QGT7 225 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 ALS2CLQ60I27 953 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 LEKR1Q6ZMV7 388 aa6.78□□□□□ -1.32
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CLTC-211ENST00000579815 AFAP1L1Q8TED9 768 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 RFFLQ8WZ73 363 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 KCNN1Q92952 543 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 CDHR1Q96JP9 859 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 C12orf42Q96LP6 360 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 RUFY1Q96T51 708 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 SYT11Q9BT88 431 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 GDF3Q9NR23 364 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.78□□□□□ -1.32
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CLTC-211ENST00000579815 VPS18Q9P253 973 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.78□□□□□ -1.32
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CLTC-211ENST00000579815 H0Y8X5 98 aa6.77□□□□□ -1.33
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CLTC-211ENST00000579815 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
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CLTC-211ENST00000579815 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CLTC-211ENST00000579815 HSF2BPO75031 334 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-211ENST00000579815 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CLTC-211ENST00000579815 ALAS1P13196 640 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-211ENST00000579815 HSPA6P17066 643 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-211ENST00000579815 VCAM1P19320 739 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-211ENST00000579815 GLDCP23378 1020 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-211ENST00000579815 CCND2P30279 289 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-211ENST00000579815 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CLTC-211ENST00000579815 GTF2H1P32780 548 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-211ENST00000579815 VAMP7P51809 220 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-211ENST00000579815 RTP1P59025 263 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-211ENST00000579815 UBXN2AP68543 259 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-211ENST00000579815 ARID5AQ03989 594 aa6.77□□□□□ -1.33
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