RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	HOXA9	P31269	272 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	OR1D2	P34982	312 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	SATB1	Q01826	763 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC6	Q16204	474 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	XKR9	Q5GH70	373 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	LIN9	Q5TKA1	542 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093		Q6ZS52	159 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	MTSS1L	Q765P7	747 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	CD163	Q86VB7	1156 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	C4orf19	Q8IY42	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	PHC3	Q8NDX5	983 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	CNNM3	Q8NE01	707 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	STK35	Q8TDR2	534 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC51	Q96ER9	411 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	SHD	Q96IW2	340 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	MTRR	Q9UBK8	725 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	MYH11	P35749	1972 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	PTPRD	P23468	1912 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A1B0GUA9	196 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093		K7ESF4	209 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	ARNTL	O00327	626 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	TBX3	O15119	743 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	MOSPD3	O75425	235 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	TADA2A	O75478	443 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	ECI2	O75521	394 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	ALX3	O95076	343 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	SEC24A	O95486	1093 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	ECEL1	O95672	775 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	C1R	P00736	705 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	PF4	P02776	101 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	PRKCB	P05771	671 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	CTSB	P07858	339 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	RHO	P08100	348 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	POU2F2	P09086	479 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	GJA1	P17302	382 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	LIG1	P18858	919 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	NOS3	P29474	1203 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	PML	P29590	882 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	AXL	P30530	894 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	ARL2	P36404	184 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	MAGEA9	P43362	315 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	GATA4	P43694	442 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	BRCC3	P46736	316 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	SOX9	P48436	509 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	FNTB	P49356	437 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	RARRES1	P49788	294 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	ARHGAP8	P85298	464 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	PFKP	Q01813	784 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	ROR1	Q01973	937 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	CREM	Q03060	361 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-206	ENST00000578093	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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