RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.43■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.43■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IL1R2P27930 398 aa22.42■■□□□ 1.18
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RGS2P41220 211 aa22.42■■□□□ 1.18
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADAM17P78536 824 aa22.42■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR6B2Q6IFH4 312 aa22.42■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TAOK1Q7L7X3 1001 aa22.42■■□□□ 1.18
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCTD6Q8NC69 237 aa22.42■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC35B2Q8TB61 432 aa22.42■■□□□ 1.18
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCDH9Q9HC56 1237 aa22.42■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.42■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SMIM23A6NLE4 172 aa22.41■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RECQL4O94761 1208 aa22.41■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ACSL3O95573 720 aa22.41■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYL3P08590 195 aa22.41■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GNAT1P11488 350 aa22.41■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DESP17661 470 aa22.41■■□□□ 1.18
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NME8Q8N427 588 aa22.41■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.41■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF560Q96MR9 790 aa22.41■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.41■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC77Q9BR77 488 aa22.41■■□□□ 1.18
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.41■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TCEA3O75764 348 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MMP13P45452 471 aa22.4■■□□□ 1.18
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MORF4L2Q15014 288 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SNX17Q15036 470 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CST9Q5W186 159 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCGF5Q86SE9 256 aa22.4■■□□□ 1.18
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NINJ2Q9NZG7 142 aa22.4■■□□□ 1.18
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GMNCA6NCL1 334 aa22.4■■□□□ 1.18
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 E5RJQ4 531 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 E7EVH7 732 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SGK1O00141 431 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CST8O60676 142 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM107AO95990 144 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PFKMP08237 780 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PNPLA4P41247 253 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SRLQ86TD4 932 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STK32AQ8WU08 396 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RABEP2Q9H5N1 569 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DPYSL4O14531 572 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRAPPC3O43617 180 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ABHD2P08910 425 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDGFRAP16234 1089 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPS1Q13098 491 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KYNUQ16719 465 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCNT1Q5JUK3 1230 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ACOT1Q86TX2 421 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SESTD1Q86VW0 696 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RXFP2Q8WXD0 754 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TTC25Q96NG3 672 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCT8L2Q96SF2 557 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 APBA2Q99767 749 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SHOC2Q9UQ13 582 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CAPN15O75808 1086 aa22.38■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCNE1P15382 129 aa22.38■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLCO1A2P46721 670 aa22.38■■□□□ 1.17
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