RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561991.5

PKD1-224, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 964 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-224	ENST00000561991	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	GBP6	Q6ZN66	633 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	GAREM2	Q75VX8	874 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	RNF135	Q8IUD6	432 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	IL21	Q9HBE4	155 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	KRT82	Q9NSB4	513 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	UST	Q9Y2C2	406 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	ASB3	Q9Y575	518 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991		A0A1W2PRU2	124 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	ASGR2	P07307	311 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	ZNF165	P49910	485 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	USP46	P62068	366 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	KCNMA1	Q12791	1236 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	IQCB1	Q15051	598 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	TEAD2	Q15562	447 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	VSTM1	Q6UX27	236 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	ITIH5	Q86UX2	942 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	SMO	Q99835	787 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	CDH7	Q9ULB5	785 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	TTC28	Q96AY4	2481 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	AP1G2	O75843	785 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	NOL4	O94818	638 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	LAMP2	P13473	410 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	GABRR2	P28476	465 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	KLK7	P49862	253 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	CYP4F8	P98187	520 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	TMEM270	Q6UE05	265 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	C8orf48	Q96LL4	319 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	CBX8	Q9HC52	389 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	18.79	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	TRIM66	O15016	1216 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	TADA3	O75528	432 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	MAP3K7CL	P57077	242 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	GCNT1	Q02742	428 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	TAF12	Q16514	161 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	SPATA17	Q96L03	361 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	TNFRSF10A	O00220	468 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	DLL1	O00548	723 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	ZNF197	O14709	1029 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	F11	P03951	625 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	CSH1	P0DML2	217 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	CSH2	P0DML3	217 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	ANXA13	P27216	316 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	PARM1	Q6UWI2	310 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	LUZP1	Q86V48	1076 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	TTC39C	Q8N584	583 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	LEMD2	Q8NC56	503 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	TFAP2B	Q92481	460 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	FGF14	Q92915	247 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	ATP8B3	O60423	1300 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-224	ENST00000561991	OBSL1	O75147	1896 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-224	ENST00000561991	FAM200B	P0CF97	657 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-224	ENST00000561991	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-224	ENST00000561991	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-224	ENST00000561991	ZNF132	P52740	706 aa		18.76	■□□□□ 0.59

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