RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560998.5

RABGGTA-220, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,997 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-220ENST00000560998 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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RABGGTA-220ENST00000560998 TBX10O75333 385 aa14.65□□□□□ -0.06
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RABGGTA-220ENST00000560998 NLRP9Q7RTR0 991 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-220ENST00000560998 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-220ENST00000560998 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-220ENST00000560998 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-220ENST00000560998 DENND1AQ8TEH3 1009 aa14.65□□□□□ -0.06
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RABGGTA-220ENST00000560998 ZNF653Q96CK0 615 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-220ENST00000560998 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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RABGGTA-220ENST00000560998 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
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RABGGTA-220ENST00000560998 HAUS5O94927 633 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-220ENST00000560998 VNN1O95497 513 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-220ENST00000560998 EDN1P05305 212 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-220ENST00000560998 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-220ENST00000560998 TGFB3P10600 412 aa14.63□□□□□ -0.07
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