RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559359.1

PSME2-208, Transcript of proteasome activator subunit 2, human

TSL 2

Gene PSME2, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME2-208	ENST00000559359	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	OSTM1	Q86WC4	334 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	LEMD2	Q8NC56	503 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	STKLD1	Q8NE28	680 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	CXorf38	Q8TB03	319 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	SHD	Q96IW2	340 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	BRD9	Q9H8M2	597 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	SIX4	Q9UIU6	781 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	L1RE1	Q9UN81	338 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME2-208	ENST00000559359	TCHH	Q07283	1943 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF233	A6NK53	670 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	FAM170B	A6NMN3	283 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	TGFB1I1	O43294	461 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	HUS1	O60921	280 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	MICAL2	O94851	1124 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	GABRR2	P28476	465 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PNPLA4	P41247	253 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	GPR15	P49685	360 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	RBP5	P82980	135 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CYP4F8	P98187	520 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PRKCQ	Q04759	706 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	UNC13D	Q70J99	1090 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	GAREM2	Q75VX8	874 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PSMG2	Q969U7	264 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	INTS13	Q9NVM9	706 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CFAP45	Q9UL16	551 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359		A0A1B0GVL5	298 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CDC14C	A4D256	554 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	TNNC2	P02585	160 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	RHOQ	P17081	205 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PSMC3	P17980	439 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	NBL1	P41271	181 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	TSPY1	Q01534	308 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	VEPH1	Q14D04	833 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	TAF12	Q16514	161 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	GPR158	Q5T848	1215 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	ATL3	Q6DD88	541 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	ITIH5	Q86UX2	942 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	ASB3	Q9Y575	518 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359		R4GN57	208 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PRR23A	A6NEV1	266 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SHISA7	A6NL88	538 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PROB1	E7EW31	1015 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF263	O14978	683 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	ATP2C2	O75185	946 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SOX11	P35716	441 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	EHHADH	Q08426	723 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	DDR2	Q16832	855 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SV2A	Q7L0J3	742 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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