RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557295.1

LINC00640-204, long intergenic non-protein coding RNA 640, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00640, Length 708 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00640-204ENST00000557295 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 UBE2FQ969M7 185 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 MAP7D2Q96T17 732 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 LZTS2Q9BRK4 669 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 LTB4R2Q9NPC1 389 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF302Q9NR11 478 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 DNAJB4Q9UDY4 337 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 SPEGQ15772 3267 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 ERICH2A1L162 156 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 TEX28O15482 410 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 B4GALT3O60512 393 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF623O75123 536 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 OFD1O75665 1012 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 EFEMP2O95967 443 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 URODP06132 367 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 TDGF1P13385 188 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 TMOD1P28289 359 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 HOXC12P31275 282 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 GRIK1P39086 918 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 GPC3P51654 580 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 CLCN3P51790 818 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 CLCN7P51798 805 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 OXCT1P55809 520 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 PFKPQ01813 784 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 UBXN2BQ14CS0 331 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 UBE2SQ16763 222 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 FAM209AQ5JX71 171 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 SWSAP1Q6NVH7 229 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 TSSK4Q6SA08 328 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 NIPA1Q7RTP0 329 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 CATIPQ7Z7H3 387 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF280BQ86YH2 543 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 FGF14Q92915 247 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 PHKBQ93100 1093 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 HSPA12BQ96MM6 686 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 TMEM175Q9BSA9 504 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 GPR62Q9BZJ7 368 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 NT5C3AQ9H0P0 336 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 LY9Q9HBG7 655 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 RCAN3Q9UKA8 241 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 CDH7Q9ULB5 785 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 RAB23Q9ULC3 237 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 RNF112Q9ULX5 631 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 FAM208BQ5VWN6 2430 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 H0Y8X5 98 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 NCAM2O15394 837 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 CPP00450 1065 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 SOD2P04179 222 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 ALDH2P05091 517 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 KIF5BP33176 963 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 SEPHS1P49903 392 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 RAB27AP51159 221 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 LIMK1P53667 647 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 AK2P54819 239 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 CDC42EP1Q00587 391 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 TRDNQ13061 729 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 MTAPQ13126 283 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 FZD5Q13467 585 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 SART3Q15020 963 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 EFCAB12Q6NXP0 572 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 PARM1Q6UWI2 310 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 MTSS1LQ765P7 747 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 GPR65Q8IYL9 337 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 RILPL2Q969X0 211 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 MYL10Q9BUA6 226 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 SEMA4GQ9NTN9 838 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 DUSP13Q9UII6 198 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 ZZEF1O43149 2961 aa7.54□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 SHISA3A0PJX4 238 aa7.54□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 HIP1O00291 1037 aa7.54□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 NRP1O14786 923 aa7.54□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 TBX1O43435 398 aa7.54□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 DYRK3O43781 588 aa7.54□□□□□ -1.2
LINC00640-204ENST00000557295 DDHD2O94830 711 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms