RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553570.5

ATXN3-222, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 757 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-222	ENST00000553570	PDHB	P11177	359 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	CALML3	P27482	149 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	PSMA5	P28066	241 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	CYP2C19	P33261	490 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	GPR3	P46089	330 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	RAB27A	P51159	221 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	ADCY1	Q08828	1119 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF543	Q08ER8	600 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	KRT32	Q14532	448 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	PTPN21	Q16825	1174 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570		Q6ZUG5	572 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	TMTC2	Q8N394	836 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	NUDT11	Q96G61	164 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	RNF146	Q9NTX7	359 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	EVPL	Q92817	2033 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	AKAP10	O43572	662 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	CYP7B1	O75881	506 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	HMGCR	P04035	888 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	KIF5B	P33176	963 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	COPB2	P35606	906 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	ANTXR2	P58335	489 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	CNTN2	Q02246	1040 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	LRRC41	Q15345	812 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	CHST13	Q8NET6	341 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	TRIB2	Q92519	343 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	ANKS1A	Q92625	1134 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	AMN	Q9BXJ7	453 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	POFUT1	Q9H488	388 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	ACAD9	Q9H845	621 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	FBXO40	Q9UH90	709 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	ALPK3	Q96L96	1907 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	RPTOR	Q8N122	1335 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	ZBTB43	O43298	467 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	PLA2G6	O60733	806 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	SGPL1	O95470	568 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	PLAT	P00750	562 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	CFB	P00751	764 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	PRL	P01236	227 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	ICAM1	P05362	532 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	CALM1	P0DP23	149 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	CALM2	P0DP24	149 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	CALM3	P0DP25	149 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	RBP3	P10745	1247 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	PTGS1	P23219	599 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	HSPA4	P34932	840 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	PLP2	Q04941	152 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	STK3	Q13188	491 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	GRM4	Q14833	912 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-222	ENST00000553570	MYBPC3	Q14896	1274 aa		5.35	□□□□□ -1.55

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