RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550808.5

MTA1-218, Transcript of metastasis associated 1, humanhuman

TSL 5

Gene MTA1, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1-218ENST00000550808 BMT2Q1RMZ1 405 aa24.74■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 ZNF516Q92618 1163 aa24.74■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 SLC22A12Q96S37 553 aa24.74■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 KIF9Q9HAQ2 790 aa24.74■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 SOBPA7XYQ1 873 aa24.73■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 EXOC3O60645 756 aa24.73■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 SLFN14P0C7P3 912 aa24.73■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 ARSAP15289 507 aa24.73■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 GRIK1P39086 918 aa24.73■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 DMWDQ09019 674 aa24.73■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 RUNX3Q13761 415 aa24.73■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 LPAL2Q16609 132 aa24.73■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 WDR72Q3MJ13 1102 aa24.73■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 MDH1BQ5I0G3 518 aa24.73■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 RMDN1Q96DB5 314 aa24.73■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.73■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 C2orf42Q9NWW7 574 aa24.73■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 NME7Q9Y5B8 376 aa24.73■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa24.72■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa24.72■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 CKMP06732 381 aa24.72■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 FNTBP49356 437 aa24.72■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 CASP4P49662 377 aa24.72■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 MYL6P60660 151 aa24.72■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 TNNC1P63316 161 aa24.72■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 TRPC3Q13507 836 aa24.72■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 CCINQ13939 588 aa24.72■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 C12orf56Q8IXR9 622 aa24.72■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 OR6B3Q8NGW1 331 aa24.72■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 PAGE5Q96GU1 130 aa24.72■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 PCED1BQ96HM7 432 aa24.72■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 CEP250Q9BV73 2442 aa24.72■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 DMXL1Q9Y485 3027 aa24.71■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 KLRC4O43908 158 aa24.71■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 PHACTR2O75167 634 aa24.71■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 CLSTN1O94985 981 aa24.71■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 USP17L7P0C7H9 530 aa24.71■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 ANXA13P27216 316 aa24.71■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 STK4Q13043 487 aa24.71■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 VSTM1Q6UX27 236 aa24.71■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 FSIP1Q8NA03 581 aa24.71■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa24.71■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 PLEKHO2Q8TD55 490 aa24.71■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 EXOC1Q9NV70 894 aa24.71■■□□□ 1.55
MTA1-218ENST00000550808 A0A1B0GVL5 298 aa24.7■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 C2orf78A6NCI8 922 aa24.7■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 TACC1O75410 805 aa24.7■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 PFKFB1P16118 471 aa24.7■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 HOXC13P31276 330 aa24.7■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 FAM160A1Q05DH4 1040 aa24.7■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 MTF1Q14872 753 aa24.7■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 PRR23BQ6ZRT6 265 aa24.7■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 CHFRQ96EP1 664 aa24.7■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 SPATA17Q96L03 361 aa24.7■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 DPEP3Q9H4B8 488 aa24.7■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 RAB23Q9ULC3 237 aa24.7■■□□□ 1.54
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MTA1-218ENST00000550808 K7ESF4 209 aa24.69■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 USP46P62068 366 aa24.69■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 BIRC3Q13489 604 aa24.69■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 KCNB1Q14721 858 aa24.69■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 PDGFRLQ15198 375 aa24.69■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 KMT5BQ4FZB7 885 aa24.69■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 FSTL4Q6MZW2 842 aa24.69■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 SYNPOQ8N3V7 929 aa24.69■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 KIAA0895Q8NCT3 520 aa24.69■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 GOLGA5Q8TBA6 731 aa24.69■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 GCNT4Q9P109 453 aa24.69■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 WNT6Q9Y6F9 365 aa24.69■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 F8VP50 259 aa24.68■■□□□ 1.54
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MTA1-218ENST00000550808 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 ZNF77Q15935 545 aa24.68■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 TMEM196Q5HYL7 178 aa24.68■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 PKN3Q6P5Z2 889 aa24.68■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa24.68■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 ELMO3Q96BJ8 720 aa24.68■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 SPATA32Q96LK8 384 aa24.68■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 XYLT2Q9H1B5 865 aa24.68■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 GMEB2Q9UKD1 530 aa24.68■■□□□ 1.54
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MTA1-218ENST00000550808 MYH10P35580 1976 aa24.67■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 MYO16Q9Y6X6 1858 aa24.67■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 A8MXQ7 604 aa24.67■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 TRIM66O15016 1216 aa24.67■■□□□ 1.54
MTA1-218ENST00000550808 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
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