RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 BACE2Q9Y5Z0 518 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ZZEF1O43149 2961 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 WDR27A2RRH5 827 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 LILRB5O75023 590 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ODC1P11926 461 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 LAMP2P13473 410 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 NR2F2P24468 414 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 VARSP26640 1264 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 GPC5P78333 572 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 DLG4P78352 724 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ROR1Q01973 937 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ADAM9Q13443 819 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 SV2CQ496J9 727 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 WSCD1Q658N2 575 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 OVOS1Q6IE37 1185 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ZNF280DQ6N043 979 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 RETREG3Q86VR2 466 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 METTL23Q86XA0 190 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 WDR49Q8IV35 697 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 SLC9A9Q8IVB4 645 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ZNF461Q8TAF7 563 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 CXorf38Q8TB03 319 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 PARD3BQ8TEW8 1205 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 TMEM209Q96SK2 561 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 CGRRF1Q99675 332 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 VRTNQ9H8Y1 702 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 PIDD1Q9HB75 910 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 DPP7Q9UHL4 492 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ITGA11Q9UKX5 1188 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 VWA8A3KMH1 1905 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ANK1P16157 1881 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 FAM170BA6NMN3 283 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 ANHXE9PGG2 379 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 CCL16O15467 120 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 PHACTR2O75167 634 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 AKAP3O75969 853 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 ABLIM3O94929 683 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 OAZ2O95190 189 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 C8AP07357 584 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 CPB1P15086 417 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 TIMP2P16035 220 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 TYMPP19971 482 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 CD72P21854 359 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 ELF1P32519 619 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 PNPLA4P41247 253 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 PMS1P54277 932 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 MYBPC2Q14324 1141 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 PPM1LQ5SGD2 360 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 ANKRD40Q6AI12 368 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 SLC8B1Q6J4K2 584 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 CLEC17AQ6ZS10 378 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 SLC7A14Q8TBB6 771 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 HDAC7Q8WUI4 952 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 ELMO3Q96BJ8 720 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 HPDLQ96IR7 371 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 ZNF560Q96MR9 790 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 PGLYRP2Q96PD5 576 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 CYP4F11Q9HBI6 524 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 LMBRD1Q9NUN5 540 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 FBXW11Q9UKB1 542 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 RAB23Q9ULC3 237 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 POLIQ9UNA4 740 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 SNX9Q9Y5X1 595 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 TRIM49BA6NDI0 452 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 PRRG1O14668 218 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 HUS1O60921 280 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 SEC24AO95486 1093 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 C1RP00736 705 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 CYP11A1P05108 521 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 CCNYL3P0C7X3 344 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 ATF2P15336 505 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 BMP6P22004 513 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 PAX3P23760 479 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 RPL13P26373 211 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 VAMP7P51809 220 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 ADCY1Q08828 1119 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 MYO1EQ12965 1108 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 BIRC3Q13489 604 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 TRPC3Q13507 836 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 MORC3Q14149 939 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 NFIL3Q16649 462 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 ZCWPW2Q504Y3 356 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 LIN9Q5TKA1 542 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 CENPPQ6IPU0 288 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 KLHL10Q6JEL2 608 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 CYP26C1Q6V0L0 522 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 THEM5Q8N1Q8 247 aa10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms