RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 RTP3Q9BQQ7 232 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 TMEM175Q9BSA9 504 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 INTS13Q9NVM9 706 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 RAD54BQ9Y620 910 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 LAMTOR5O43504 91 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 AP1G2O75843 785 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 FNTBP49356 437 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 NDST1P52848 882 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 RBP5P82980 135 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 KCNC3Q14003 757 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 RAB33AQ14088 237 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 VITQ6UXI7 678 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 B3GNT5Q9BYG0 378 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 KRT82Q9NSB4 513 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.124e-19■■■■□ 26.4
CS-212ENST00000548567 NAGPAQ9UK23 515 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 NME7Q9Y5B8 376 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 SIP14410 1827 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 PCNX2A6NKB5 2137 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.12
CS-212ENST00000548567 TBC1D3BA6NDS4 549 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 PRR33A8MZF0 331 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 LOC730098B7Z3J9 87 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 XPOTO43592 962 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 TBC1D4O60343 1298 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 BMP15O95972 392 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 SLC6A11P48066 632 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 DGKEP52429 567 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 ZXDBP98169 803 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 POSTNQ15063 836 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 E2F4Q16254 413 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 SLFN12LQ6IEE8 588 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 CEP68Q76N32 757 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 FAM186BQ8IYM0 893 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 ADSSL1Q8N142 457 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 FAM3CQ92520 227 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 GCNAQ96QF7 691 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 MYOCQ99972 504 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 CNTN3Q9P232 1028 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 LZTS1Q9Y250 596 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 KCNK3O14649 394 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 RNF40O75150 1001 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 HLA-DRAP01903 254 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 USP17L7P0C7H9 530 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 SLFN14P0C7P3 912 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 KRT13P13646 458 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 EFEMP1Q12805 493 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 ANKRD40Q6AI12 368 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 KRBA2Q6ZNG9 492 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 SH3RF2Q8TEC5 729 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 HMGB4Q8WW32 186 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 FBXO32Q969P5 355 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 RNF31Q96EP0 1072 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 SDCBP2Q9H190 292 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 CD93Q9NPY3 652 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 NCDNQ9UBB6 729 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 STK17AQ9UEE5 414 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 CEP83Q9Y592 693 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 CPQQ9Y646 472 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 MSI1O43347 362 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 CD44P16070 742 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 PSMC3P17980 439 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 ANXA13P27216 316 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 MYL7Q01449 175 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 TMEM270Q6UE05 265 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 LAYNQ6UX15 382 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 ALKAL1Q6UXT8 129 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 SMARCE1Q969G3 411 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 NECTIN4Q96NY8 510 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 CIPCQ9C0C6 399 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 CFAP97Q9P2B7 532 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP8.01□□□□□ -1.131e-8■■■□□ 17.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms