RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 PFDN1O60925 122 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CABYRO75952 493 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MLNP12872 115 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MAPK1P28482 360 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CNTN1Q12860 1018 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF280DQ6N043 979 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ARL8AQ96BM9 186 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM161AQ9NX61 479 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 WHRNQ9P202 907 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NUP98P52948 1817 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 UBR2Q8IWV8 1755 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TIMM44O43615 452 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 VCAM1P19320 739 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PTGER2P43116 358 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PCSK7Q16549 785 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ANKS6Q68DC2 871 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ATG4CQ96DT6 458 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MROH1Q8NDA8 1641 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RPN2P04844 631 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CHGBP05060 677 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CKBP12277 381 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF284Q2VY69 593 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 STOX1Q6ZVD7 989 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ZFP42Q96MM3 310 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CNPY3Q9BT09 278 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 STK39Q9UEW8 545 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SUFUQ9UMX1 484 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RGPD2P0DJD1 1756 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 HMBSP08397 361 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 LCA5Q86VQ0 697 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 KCNK16Q96T55 309 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RBBP8Q99708 897 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 AMACRQ9UHK6 382 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FAM205AQ6ZU69 1335 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF839A8K0R7 811 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MAGEA9P43362 315 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SH3GL1Q99961 368 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MAF1Q9H063 256 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 NUMA1Q14980 2115 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGEF9O43307 516 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ATXN8OSP0DMR3 200 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TMC2Q8TDI7 906 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SERPINB12Q96P63 405 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ARMC7Q9H6L4 198 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 NAV1Q8NEY1 1877 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 M0QYT0 321 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MSH4O15457 936 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 GUCA1CO95843 209 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 GNRH1P01148 92 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 WEE2P0C1S8 567 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 POU4F1Q01851 419 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PTK7Q13308 1070 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 C3orf20Q8ND61 904 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CGRRF1Q99675 332 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PLA2G4CQ9UP65 541 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 KIF13AQ9H1H9 1805 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ADGRB1O14514 1584 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 XYLBO75191 536 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 GZMAP12544 262 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TGM2P21980 687 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PPATQ06203 517 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ACAP1Q15027 740 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 HORMAD1Q86X24 394 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 IPMKQ8NFU5 416 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CARD9Q9H257 536 aa6.64□□□□□ -1.35
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