RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540240.1

C16orf62-212, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 633 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-212ENST00000540240 PPP2R5AQ15172 486 aa8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 CALCRLQ16602 461 aa8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF461Q8TAF7 563 aa8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 ITFG1Q8TB96 612 aa8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 RABGGTAQ92696 567 aa8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 DNASE1L2Q92874 299 aa8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 ELSPBP1Q96BH3 223 aa8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 KXD1Q9BQD3 176 aa8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 PAAF1Q9BRP4 392 aa8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 RTKNQ9BST9 563 aa8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 EPC1Q9H2F5 836 aa8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 TUFT1Q9NNX1 390 aa8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 SNTG2Q9NY99 539 aa8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 MTRRQ9UBK8 725 aa8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 GMEB2Q9UKD1 530 aa8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 RAB23Q9ULC3 237 aa8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 USO1O60763 962 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 PFKFB2O60825 505 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 RECQL4O94761 1208 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 B3GAT3O94766 335 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 B3GALT4O96024 378 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 ABL1P00519 1130 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 LRG1P02750 347 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 NAMPTP43490 491 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 EFNA5P52803 228 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 SCRN1Q12765 414 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 PLCL1Q15111 1095 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 ANKRD1Q15327 319 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 NAB2Q15742 525 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 TPRG1Q6ZUI0 275 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 DEPTORQ8TB45 409 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 PIGOQ8TEQ8 1089 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 HASPINQ8TF76 798 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 MCRS1Q96EZ8 462 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 CORO1BQ9BR76 489 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 PDZD7Q9H5P4 517 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 ZFP14Q9HCL3 533 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 TRPV5Q9NQA5 729 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 MAFFQ9ULX9 164 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 CDY1Q9Y6F8 540 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 MIA3Q5JRA6 1907 aa8.42□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 DOCK8Q8NF50 2099 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 MYH15Q9Y2K3 1946 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 ARHGEF37A1IGU5 675 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 H7C4K7 107 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 ADAM12O43184 909 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 NEMFO60524 1076 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 PRKCBP05771 671 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 RHOP08100 348 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 CYP11B2P19099 503 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 CD72P21854 359 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 MUTP22033 750 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 TRIM29Q14134 588 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 CYP4A22Q5TCH4 519 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 C1orf228Q6PIY5 440 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 MAEAQ7L5Y9 396 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 SKAP1Q86WV1 359 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 NOSTRINQ8IVI9 506 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 ELMOD1Q8N336 334 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 ERMNQ8TAM6 284 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 E2F7Q96AV8 911 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 IFT74Q96LB3 600 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 MTMR9Q96QG7 549 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 GPR88Q9GZN0 384 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 BRD9Q9H8M2 597 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 SLC38A7Q9NVC3 462 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 USP18Q9UMW8 372 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 U3KQE9 123 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 CACNA1HO95180 2353 aa8.41□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 PATJQ8NI35 1801 aa8.4□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa8.4□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 ARHGEF35A5YM69 484 aa8.4□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 PRRG1O14668 218 aa8.4□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 SYN3O14994 580 aa8.4□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms