RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538333.3

LIMK1-208, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LIMK1, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-208ENST00000538333 MAGEA4P43358 317 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 GPS1Q13098 491 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 MORF4L2Q15014 288 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 TRNP1Q6NT89 227 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 MICALCLQ6ZW33 695 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ACTL9Q8TC94 416 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 CST8O60676 142 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 GPR32O75388 356 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 CREB1P16220 341 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 MYO1EQ12965 1108 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 DERAQ9Y315 318 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 PCNTO95613 3336 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 C2CD4BA6NLJ0 364 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 NPTXRO95502 500 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 PCK1P35558 622 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 TAF5Q15542 800 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ZBTB6Q15916 424 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 VSTM1Q6UX27 236 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 C12orf29Q8N999 325 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 TTC13Q8NBP0 860 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 SNX27Q96L92 541 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 PEBP4Q96S96 227 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 PCSK1NQ9UHG2 260 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 USP18Q9UMW8 372 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 A6NJR5 290 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 E5RJQ4 531 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 SGK1O00141 431 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 PPEF2O14830 753 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 RNF8O76064 485 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ATP5DP30049 168 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 DYNLT1P63172 113 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 FKBP1BP68106 108 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 TMEM62Q0P6H9 643 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 STAT4Q14765 748 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 PKDCCQ504Y2 493 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 SPRYD7Q5W111 196 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 CYP4X1Q8N118 509 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 SAYSD1Q9NPB0 183 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 SNTG2Q9NY99 539 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 NME7Q9Y5B8 376 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 CDH16O75309 829 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 ENDOD1O94919 500 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 F2P00734 622 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 GDF10P55107 478 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 PLCB3Q01970 1234 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 STILQ15468 1287 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 DPH6Q7L8W6 267 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 KAT2BQ92831 832 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 CNPY3Q9BT09 278 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 ASNSD1Q9NWL6 643 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 TMEM120BA0PK00 339 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 IFNB1P01574 187 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 GPD1P21695 349 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 IFT88Q13099 833 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMK1-208ENST00000538333 RAB6CQ53S08 254 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms