RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527622.5

CTTN-211, Transcript of cortactin, humanhuman

TSL 4

Gene CTTN, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTN-211ENST00000527622 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 SLFN14P0C7P3 912 aa20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 HOXC13P31276 330 aa20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 AVPR1AP37288 418 aa20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 STK4Q13043 487 aa20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 USP4Q13107 963 aa20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 PON2Q15165 354 aa20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 ZNF77Q15935 545 aa20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 TRIM68Q6AZZ1 485 aa20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 SPEM1Q8N4L4 309 aa20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 GKN1Q9NS71 199 aa20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 GCNT4Q9P109 453 aa20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 CFAP45Q9UL16 551 aa20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 HPSEQ9Y251 543 aa20.15■□□□□ 0.82
CTTN-211ENST00000527622 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 TNNI1P19237 187 aa20.14■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 CASP4P49662 377 aa20.14■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 USP46P62068 366 aa20.14■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 DMWDQ09019 674 aa20.14■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 LRRC32Q14392 662 aa20.14■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 DGKKQ5KSL6 1271 aa20.14■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 VSTM1Q6UX27 236 aa20.14■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.14■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 KIAA2013Q8IYS2 634 aa20.14■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.14■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 PAGE5Q96GU1 130 aa20.14■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 PCED1BQ96HM7 432 aa20.14■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 SPATA17Q96L03 361 aa20.14■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 DMAC2Q9NW81 257 aa20.14■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 LAMA1P25391 3075 aa20.13■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 ARSAP15289 507 aa20.13■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 PFKFB1P16118 471 aa20.13■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 BDNFP23560 247 aa20.13■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 ID4P47928 161 aa20.13■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 CLDN10P78369 228 aa20.13■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.13■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.13■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.13■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 RMDN1Q96DB5 314 aa20.13■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 FNBP1Q96RU3 617 aa20.13■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.13■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.13■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.13■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 EBF3Q9H4W6 596 aa20.13■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 C2orf78A6NCI8 922 aa20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 PDGFRBP09619 1106 aa20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 TGM1P22735 817 aa20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 CXCL12P48061 93 aa20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 CACNA2D1P54289 1103 aa20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 MYL6P60660 151 aa20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 RUNX3Q13761 415 aa20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 TMEM196Q5HYL7 178 aa20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 CYP2S1Q96SQ9 504 aa20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 MMS19Q96T76 1030 aa20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 VRTNQ9H8Y1 702 aa20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 TPRP12270 2363 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 A0A1B0GVL5 298 aa20.11■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 FAM163BP0C2L3 166 aa20.11■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 TCF3P15923 654 aa20.11■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 CMA1P23946 247 aa20.11■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 ZXDBP98169 803 aa20.11■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 MTF1Q14872 753 aa20.11■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.11■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.11■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.11■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.11■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 F8VP50 259 aa20.1■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 EXOC3O60645 756 aa20.1■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 VNN1O95497 513 aa20.1■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 NRLP54845 237 aa20.1■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 CYP27A1Q02318 531 aa20.1■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.1■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 SYNPOQ8N3V7 929 aa20.1■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.1■□□□□ 0.81
CTTN-211ENST00000527622 HINFPQ9BQA5 517 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.4 ms