RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524255.5

SFTPC-210, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SFTPC, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-210ENST00000524255 STK33Q9BYT3 514 aa18.05■□□□□ 0.48
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SFTPC-210ENST00000524255 GFPT2O94808 682 aa18■□□□□ 0.47
SFTPC-210ENST00000524255 GYPCP04921 128 aa18■□□□□ 0.47
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SFTPC-210ENST00000524255 CYP27A1Q02318 531 aa18■□□□□ 0.47
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