RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 SFT2D3Q587I9 215 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 NLRP9Q7RTR0 991 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 FAM83AQ86UY5 434 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 SCYL3Q8IZE3 742 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 MYCT1Q8N699 235 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 AGBL3Q8NEM8 1001 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 SLC5A5Q92911 643 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 GOLPH3Q9H4A6 298 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 GPAMQ9HCL2 828 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 SLC38A7Q9NVC3 462 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 CEPT1Q9Y6K0 416 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 A0A087X0T9 212 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 PDXKO00764 312 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 CALUO43852 315 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 MAGEC1O60732 1142 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 EGFRP00533 1210 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 CD48P09326 243 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 FAM228BP0C875 321 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 SLC9A1P19634 815 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 ENTPD1P49961 510 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 PRELPP51888 382 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 CREB5Q02930 508 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 DNAJC3Q13217 504 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 ARHGEF6Q15052 776 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 FKBP1CQ5VVH2 108 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 NIPAL1Q6NVV3 410 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 FAM160B2Q86V87 743 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 JAMLQ86YT9 394 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 CPXCR1Q8N123 301 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 LZTR1Q8N653 840 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 PPP4R1Q8TF05 950 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 EME1Q96AY2 570 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 SGF29Q96ES7 293 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 TUFT1Q9NNX1 390 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 HOMER2Q9NSB8 354 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 ARL8BQ9NVJ2 186 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 FEM1BQ9UK73 627 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 ATAD5Q96QE3 1844 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 TBKBP1A7MCY6 615 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 NFIBO00712 420 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 PARNO95453 639 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
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TRPS1-209ENST00000519674 ACTR3P61158 418 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 C16orf72Q14CZ0 275 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 PHKG1Q16816 387 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 PTPROQ16827 1216 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 FBXL19Q6PCT2 694 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 POTEHQ6S545 545 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 LRRC6Q86X45 466 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 VPS52Q8N1B4 723 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 MARVELD2Q8N4S9 558 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 HES6Q96HZ4 224 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 CTRCQ99895 268 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
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TRPS1-209ENST00000519674 MYOZ2Q9NPC6 264 aa8.85□□□□□ -0.99
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TRPS1-209ENST00000519674 MKS1Q9NXB0 559 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
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TRPS1-209ENST00000519674 ADCY6O43306 1168 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 TCEA3O75764 348 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 BAIAP3O94812 1187 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 RARBP10826 455 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 HSD17B4P51659 736 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 TUBA1BP68363 451 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 MAPK7Q13164 816 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 APOFQ13790 326 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 KYNUQ16719 465 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 BMT2Q1RMZ1 405 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 C1orf186Q6ZWK4 172 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 TUBA1AQ71U36 451 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 ANO5Q75V66 913 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 FRMD5Q7Z6J6 570 aa8.85□□□□□ -0.99
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