RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 CAVIN4Q5BKX8 364 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 C1QL3Q5VWW1 255 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 AFMIDQ63HM1 303 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 ANKS6Q68DC2 871 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 Q6ZRM9 215 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 XYLT1Q86Y38 959 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 PALM2Q8IXS6 379 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 PRR18Q8N4B5 295 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 CERS5Q8N5B7 392 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 STON2Q8WXE9 905 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 GPR87Q9BY21 358 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 USP44Q9H0E7 712 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 DEFB129Q9H1M3 183 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 PSME4Q14997 1843 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 UBE2Q2LH0YL09 131 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 SNAP23O00161 211 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 PLIN1O60240 522 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 PDE8BO95263 885 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 ADRB1P08588 477 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 DDCP20711 480 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 PCSK1P29120 753 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 RGS19P49795 217 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 SCNN1GP51170 649 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 CLRN1P58418 232 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 SREBF2Q12772 1141 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 CRHR2Q13324 411 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 USP45Q70EL2 814 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 TTC7BQ86TV6 843 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 ANKRD44Q8N8A2 993 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 VGLL2Q8N8G2 317 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 ZFP28Q8NHY6 868 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 MNTQ99583 582 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 MRIQ9BWK5 157 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 RNF186Q9NXI6 227 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 CACNA1FO60840 1977 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 MYH3P11055 1940 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 RAP2AP10114 183 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 HK1P19367 917 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 FPR1P21462 350 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 MGAT1P26572 445 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 CYP2C19P33261 490 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 ALDH1A3P47895 512 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 CTXN1P60606 82 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 RAB39AQ14964 217 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 EFCAB12Q6NXP0 572 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 RSPH3Q86UC2 560 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 ARHGAP45Q92619 1136 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 TFAP2CQ92754 450 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 KAT5Q92993 513 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 MRI1Q9BV20 369 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 SMC4Q9NTJ3 1288 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 ACTL7AQ9Y615 435 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 MAST3O60307 1309 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 EYA2O00167 538 aa7.36□□□□□ -1.23
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PDE4D-225ENST00000515835 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 ATP5JP18859 108 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 FGFR2P21802 821 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 GYG1P46976 350 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 DSC2Q02487 901 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 PPP2R5AQ15172 486 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 ATP2B3Q16720 1220 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 LRRC24Q50LG9 513 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 SPDYAQ5MJ70 313 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 FKBP1CQ5VVH2 108 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 MOB2Q70IA6 237 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 DRC7Q8IY82 874 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 LPIN2Q92539 896 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 TMX3Q96JJ7 454 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 AIFM3Q96NN9 605 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 GPR20Q99678 358 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
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