RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 VSTM1Q6UX27 236 aa26.37■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 C12orf56Q8IXR9 622 aa26.37■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 FSIP1Q8NA03 581 aa26.37■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 RIN3Q8TB24 985 aa26.37■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 GMEB2Q9UKD1 530 aa26.37■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 RAB23Q9ULC3 237 aa26.37■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 CST3P01034 146 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 CKMP06732 381 aa26.36■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 PDGFRBP09619 1106 aa26.36■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 TNNC1P63316 161 aa26.36■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 MTF1Q14872 753 aa26.36■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa26.36■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.36■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 SPATA17Q96L03 361 aa26.36■■□□□ 1.81
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ALYREF-203ENST00000511412 SNX25Q9H3E2 840 aa26.36■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 GPR179Q6PRD1 2367 aa26.36■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 HELZP42694 1942 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
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ALYREF-203ENST00000511412 TACC1O75410 805 aa26.35■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 USP17L7P0C7H9 530 aa26.35■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 BDNFP23560 247 aa26.35■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 ANXA13P27216 316 aa26.35■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 GRIK1P39086 918 aa26.35■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 USP4Q13107 963 aa26.35■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 TRPC3Q13507 836 aa26.35■■□□□ 1.81
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ALYREF-203ENST00000511412 PCED1BQ96HM7 432 aa26.35■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 CEP295NLQ96MC4 621 aa26.35■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 SERTAD1Q9UHV2 236 aa26.35■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa26.35■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 K7ESF4 209 aa26.34■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 TRIM66O15016 1216 aa26.34■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 ARSAP15289 507 aa26.34■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 AMPD2Q01433 879 aa26.34■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 KCNB1Q14721 858 aa26.34■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF77Q15935 545 aa26.34■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 WDR72Q3MJ13 1102 aa26.34■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 MDH1BQ5I0G3 518 aa26.34■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 TTC16Q8NEE8 873 aa26.34■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 OR6B3Q8NGW1 331 aa26.34■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 GOLGA5Q8TBA6 731 aa26.34■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa26.34■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 RCOR1Q9UKL0 485 aa26.34■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa26.33■■□□□ 1.81
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ALYREF-203ENST00000511412 SLFN14P0C7P3 912 aa26.33■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
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ALYREF-203ENST00000511412 DMWDQ09019 674 aa26.33■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM196Q5HYL7 178 aa26.33■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 PRR23BQ6ZRT6 265 aa26.33■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa26.33■■□□□ 1.81
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ALYREF-203ENST00000511412 SLC22A12Q96S37 553 aa26.33■■□□□ 1.81
ALYREF-203ENST00000511412 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
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ALYREF-203ENST00000511412 C2orf78A6NCI8 922 aa26.32■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 FAM163BP0C2L3 166 aa26.32■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 PDE6CP51160 858 aa26.32■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP26.32■■□□□ 1.81e-7■□□□□ 10.1
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ALYREF-203ENST00000511412 LAIR1Q6GTX8 287 aa26.32■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 FSTL4Q6MZW2 842 aa26.32■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 CPA6Q8N4T0 437 aa26.32■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 OSCP1Q8WVF1 389 aa26.32■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF516Q92618 1163 aa26.32■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 CHFRQ96EP1 664 aa26.32■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 CYP2S1Q96SQ9 504 aa26.32■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 C2orf42Q9NWW7 574 aa26.32■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 EHD2Q9NZN4 543 aa26.32■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 GCNT4Q9P109 453 aa26.32■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 NME7Q9Y5B8 376 aa26.32■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
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ALYREF-203ENST00000511412 CLSTN1O94985 981 aa26.31■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 ATICP31939 592 aa26.31■■□□□ 1.8
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ALYREF-203ENST00000511412 IFNAR2P48551 515 aa26.31■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 MYL6P60660 151 aa26.31■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 KIAA0895Q8NCT3 520 aa26.31■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 PAGE5Q96GU1 130 aa26.31■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 USP18Q9UMW8 372 aa26.31■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 F8VP50 259 aa26.3■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 PFKFB1P16118 471 aa26.3■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 CASP4P49662 377 aa26.3■■□□□ 1.8
ALYREF-203ENST00000511412 BIRC3Q13489 604 aa26.3■■□□□ 1.8
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