RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GKN1Q9NS71 199 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 R4GN57 208 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A8MXQ7 604 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIM66O15016 1216 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAPK13O15264 365 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHRNB1P11230 501 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 P4HA1P13674 534 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PFKLP17858 780 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CTHP32929 405 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CASP4P49662 377 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PDE6CP51160 858 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MTAPQ13126 283 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NCOA4Q13772 614 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCNB1Q14721 858 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC142Q17RM4 750 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF699Q32M78 642 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF667Q5HYK9 610 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DGKKQ5KSL6 1271 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADSSL1Q8N142 457 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLEKHO2Q8TD55 490 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATRIPQ8WXE1 791 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TAF4BQ92750 862 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C8orf48Q96LL4 319 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM83CQ9BQN1 747 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZSCAN32Q9NX65 697 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GTSE1Q9NYZ3 720 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MIA3Q5JRA6 1907 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KINO60870 393 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 USP17L7P0C7H9 530 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPL13P26373 211 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP3CCP48454 512 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NRLP54845 237 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NOP14P78316 857 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NUCB2P80303 420 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AMPD2Q01433 879 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM160A1Q05DH4 1040 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NFIL3Q16649 462 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZACNQ401N2 412 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MDH1BQ5I0G3 518 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CEP135Q66GS9 1140 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STKLD1Q8NE28 680 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NELL1Q92832 810 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TNIP3Q96KP6 325 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ELOVL4Q9GZR5 314 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCL26Q9Y258 94 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COL4A3Q01955 1670 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TADA3O75528 432 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRR29P0C7W0 189 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SOX9P48436 509 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCR3P51677 355 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ENPEPQ07075 957 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TNK2Q07912 1038 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RUNX3Q13761 415 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PDGFRLQ15198 375 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SYNPOQ8N3V7 929 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPEM1Q8N4L4 309 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZBTB44Q8NCP5 570 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TTLL2Q9BWV7 592 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRPC7Q9HCX4 862 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM186AA6NE01 2351 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 F8VP50 259 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLSTN1O94985 981 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VNN1O95497 513 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CKMP06732 381 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HDCP19113 662 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NR2F2P24468 414 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CXCL12P48061 93 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VAMP7P51809 220 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DLG4P78352 724 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TXNDC11Q6PKC3 985 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SV2AQ7L0J3 742 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TTC8Q8TAM2 541 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EXOC4Q96A65 974 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYP2S1Q96SQ9 504 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GDPD2Q9HCC8 539 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GCNT4Q9P109 453 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NME7Q9Y5B8 376 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATP8B3O60423 1300 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRT13P13646 458 aa16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms