RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496910.1

EXOSC3-208, Transcript of exosome component 3, human

TSL 2

Gene EXOSC3, Length 217 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EXOSC3-208	ENST00000496910	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	CNR2	P34972	360 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	LIFR	P42702	1097 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	SLC6A9	P48067	706 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	MEOX1	P50221	254 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	SLC5A3	P53794	718 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	PPP2CB	P62714	309 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	PPP2CA	P67775	309 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	MGAT2	Q10469	447 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	TAF12	Q16514	161 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	SNX33	Q8WV41	574 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	RABGGTA	Q92696	567 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	LPP	Q93052	612 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	COA7	Q96BR5	231 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	CDHR1	Q96JP9	859 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	GREM2	Q9H772	168 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	CEP72	Q9P209	647 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	PXDN	Q92626	1479 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	COL15A1	P39059	1388 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	FAM170A	A1A519	330 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	GPR42	O15529	346 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	FRS3	O43559	492 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	KALRN	O60229	2985 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	MGEA5	O60502	916 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	ALDH1A2	O94788	518 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	PLAT	P00750	562 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	IGHD	P01880	384 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	INHBB	P09529	407 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	MYF5	P13349	255 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	TSHR	P16473	764 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	HOXA5	P20719	270 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	SCP2	P22307	547 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	ATIC	P31939	592 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	KRT9	P35527	623 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	ARL4C	P56559	192 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	NRG3	P56975	720 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	WASHC5	Q12768	1159 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	PRKG1	Q13976	671 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	KIF22	Q14807	665 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	STARD3	Q14849	445 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	CCNG2	Q16589	344 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	FAM124A	Q86V42	546 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	FATE1	Q969F0	183 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EXOSC3-208	ENST00000496910	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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