RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496015.5

ABCD4-217, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 5

Gene ABCD4, Length 1,248 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-217ENST00000496015 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 CHRDQ9H2X0 955 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 SHISA7A6NL88 538 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa14.56□□□□□ -0.08
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ABCD4-217ENST00000496015 USP17L7P0C7H9 530 aa14.56□□□□□ -0.08
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ABCD4-217ENST00000496015 BDNFP23560 247 aa14.56□□□□□ -0.08
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ABCD4-217ENST00000496015 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
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ABCD4-217ENST00000496015 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 ZNF516Q92618 1163 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 TRPC7Q9HCX4 862 aa14.56□□□□□ -0.08
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ABCD4-217ENST00000496015 ZSCAN32Q9NX65 697 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 GTSE1Q9NYZ3 720 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 ZNF292O60281 2723 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 A8MXQ7 604 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 CKMP06732 381 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 CHRNB1P11230 501 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 CASP4P49662 377 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 CLDN10P78369 228 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 NCOA4Q13772 614 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 ZNF699Q32M78 642 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 CEP135Q66GS9 1140 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 STKLD1Q8NE28 680 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 TTC8Q8TAM2 541 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 EXOC4Q96A65 974 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 PCED1BQ96HM7 432 aa14.55□□□□□ -0.08
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ABCD4-217ENST00000496015 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
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ABCD4-217ENST00000496015 MYH10P35580 1976 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 IKBKBO14920 756 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 RHOBTB3O94955 611 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 PFKLP17858 780 aa14.54□□□□□ -0.08
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ABCD4-217ENST00000496015 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 CXCL12P48061 93 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 SOX9P48436 509 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 PPP3CCP48454 512 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 TNK2Q07912 1038 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 KCNB1Q14721 858 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 PDGFRLQ15198 375 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 CCDC142Q17RM4 750 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 SYNPOQ8N3V7 929 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 SPEM1Q8N4L4 309 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 TMC2Q8TDI7 906 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 TNIP3Q96KP6 325 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 C8orf48Q96LL4 319 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 XYLT2Q9H1B5 865 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 CCL26Q9Y258 94 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 ZNF202O95125 648 aa14.53□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 HDCP19113 662 aa14.53□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 RUNX3Q13761 415 aa14.53□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 PON2Q15165 354 aa14.53□□□□□ -0.08
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ABCD4-217ENST00000496015 TTC16Q8NEE8 873 aa14.53□□□□□ -0.08
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