RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 LRRC19Q9H756 370 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 VPS37BQ9H9H4 285 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 VAT1LQ9HCJ6 419 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 DNAJC12Q9UKB3 198 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 DTNAQ9Y4J8 743 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 UBR3Q6ZT12 1888 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 ATAD5Q96QE3 1844 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 CBFA2T3O75081 653 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 ATE1O95260 518 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 ATF2P15336 505 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 SSTR1P30872 391 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 SOX5P35711 763 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 STAT1P42224 750 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 STAT4Q14765 748 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 CBWD6Q4V339 395 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 CBWD3Q5JTY5 395 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 EFHC1Q5JVL4 640 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 CBWD5Q5RIA9 395 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 PYROXD1Q8WU10 500 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 KAT5Q92993 513 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 TTC25Q96NG3 672 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 DCLK3Q9C098 648 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 MAGEF1Q9HAY2 307 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF287Q9HBT7 754 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 RSPH10B2B2RC85 870 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 PIK3R2O00459 728 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 PLOD2O00469 737 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 CYB561D2O14569 222 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 RSPH10BP0C881 870 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 TRIM49P0CI25 452 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 TRIM49CP0CI26 452 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 TNFAIP3P21580 790 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 CALML3P27482 149 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 RFC4P35249 363 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 GPX6P59796 221 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 MYBPC2Q14324 1141 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 COG2Q14746 738 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 UBL4BQ8N7F7 174 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 PLEKHA8Q96JA3 519 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 AK8Q96MA6 479 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 CEP63Q96MT8 703 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 ACAP3Q96P50 834 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 CCDC106Q9BWC9 280 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 UBA5Q9GZZ9 404 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 C10orf88Q9H8K7 445 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 GPAMQ9HCL2 828 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 UVRAGQ9P2Y5 699 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 CASZ1Q86V15 1759 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 DUOX1Q9NRD9 1551 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 USP17L3A6NCW0 530 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 USP17L4A6NCW7 530 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 AQP9O43315 295 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 DDAH1O94760 285 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 APBA3O96018 575 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 PROCP04070 461 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 LDHCP07864 332 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 NAT2P11245 290 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 CDH3P22223 829 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 CARTPTQ16568 116 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF804AQ7Z570 1209 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 VPS36Q86VN1 386 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 LILRA2Q8N149 483 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 SERAC1Q96JX3 654 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 MTMR9Q96QG7 549 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 HGH1Q9BTY7 390 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 GPRC5DQ9NZD1 345 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 MAD2L2Q9UI95 211 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 JAG2Q9Y219 1238 aa8.94□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 LOC100653049A0A140TA62 436 aa8.93□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.93□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 ANKRD62A6NC57 917 aa8.93□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa8.93□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141 ms