RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 PRAMEF12O95522 483 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 VAMP7P51809 220 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC142Q17RM4 750 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 MAMSTRQ6ZN01 415 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 SV2AQ7L0J3 742 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF687Q8N1G0 1237 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 TNIP3Q96KP6 325 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 C8orf48Q96LL4 319 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 GSDMAQ96QA5 445 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 ELOVL4Q9GZR5 314 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 TDP1Q9NUW8 608 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 FBXO4Q9UKT5 387 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 LAMTOR5O43504 91 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 KRT13P13646 458 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 PFKLP17858 780 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 PPP3CCP48454 512 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 PDE6CP51160 858 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 DLG4P78352 724 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM160A1Q05DH4 1040 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 ADAM9Q13443 819 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 EDRF1Q3B7T1 1238 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF528Q3MIS6 628 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 MDH1BQ5I0G3 518 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 TXNDC8Q6A555 127 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 GPIHBP1Q8IV16 184 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 TIGD1Q96MW7 591 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 AKAP3O75969 853 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 SMC2O95347 1197 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 VNN1O95497 513 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 NOP14P78316 857 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 FZD5Q13467 585 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 FRMD5Q7Z6J6 570 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 ENGASEQ8NFI3 743 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 VPS13AQ96RL7 3174 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 CLSTN1O94985 981 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 SP9P0CG40 484 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 ZCWPW2Q504Y3 356 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 COBLL1Q53SF7 1204 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM186BQ8IYM0 893 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 TTLL2Q9BWV7 592 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 SMYD3Q9H7B4 428 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 NME7Q9Y5B8 376 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP8B3O60423 1300 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 ASS1P00966 412 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 USP17L7P0C7H9 530 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 CCNE1P24864 410 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 GTF2H1P32780 548 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 PNOCQ13519 176 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 C1orf220Q5T0J3 134 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM83CQ9BQN1 747 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 IMPG2Q9BZV3 1241 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 CHRDQ9H2X0 955 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 DPEP3Q9H4B8 488 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 USP34Q70CQ2 3546 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 MIA3Q5JRA6 1907 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 F8VP50 259 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 TADA3O75528 432 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 CDH8P55286 799 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 LRRC32Q14392 662 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 UNC93AQ86WB7 457 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 STKLD1Q8NE28 680 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 SPATA20Q8TB22 786 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 ZFYVE19Q96K21 471 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 B3GNT5Q9BYG0 378 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 LMAN1LQ9HAT1 526 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 GKN1Q9NS71 199 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 PRR23AA6NEV1 266 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 CETN3O15182 167 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 CTHP32929 405 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 PIK3CAP42336 1068 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 AMPD2Q01433 879 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 PPP2R5DQ14738 602 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 PDGFRLQ15198 375 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDSP1-211ENST00000492545 FAXDC2Q96IV6 333 aa25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms